Project information
Vývoj vnitřní kontroly pro metagenomické analýzy

Cílem projektu je vyvinout prototyp komplexního řešení pro normalizaci analýz lidského mikrobiomu za pomocí užití vnitřní kontroly při sekvenaci genu pro 16S rRNA. K tomuto vedou jednotlivé dílčí cíle:
1. Výběr bakteriálních kmenů o potřebné biologické diverzitě, které se v lidském mikrobiomu nevyskytují a jsou kultivovatelné (08/2019).
2. Podrobná charakterizace a testování vybraných kmenů a příprava funkčních vzorků vnitřních kontrol z vhodných kandidátů (G funkční vzorek, 05/2020).
3. Ověření reprodukovatelnosti a robustnosti jednotlivých funknčních vzorků pomocí sekvenace genu pro 16S rRNA (F užitný vzor, 11/2020).
4. Testování vybrané vnitřní kontroly na reálných vzorcích a vývoj algoritmu pro normalizaci vzorků (odstranění nežádoucích efektů) (G funkční vzorek, 4/2021).