Mgr. Eva Budinská, Ph.D.
BUDINSKÁ, Eva - JANOTOVÁ, Andrea - TEJPAR, sabine - POPOVICI, Vlad - D’ARIO, Giovanni - LAPIQUE, Nicolas - KATARZYNA OTYLIA, Sikora - ANTONIO FABIO, Di Narzo - PU, Yan - JOHN GRAEME, Hodgson - SCOTT, Weinrich - FRED, Bosman - ARNAUD, Roth - MAURO, Delorenzi.
Colorectal cancer heterogeneity from a gene expression perspective. 2013.
XIE, Tao - D’ ARIO, Giovanni - LAMB, John R. - MARTIN, Eric - WANG, Kai - TEJPAR, Sabine - DELORENZI, Mauro - BOSMAN, Fred T. - ROTH, Arnaud D. - PU, Yan - STEPHANIE, Bougel - ANTONIO FABIO, Di Narzo - POPOVICI, Vlad - BUDINSKÁ, Eva - MAO, Mao - WEINRICH, Scott L. - PAUL A., Rejto - HODGSON, J. Graeme.
A Comprehensive Characterization of Genome-Wide Copy Number Aberrations in Colorectal Cancer Reveals Novel Oncogenes and Patterns of Alterations. PLoS One, San Francisco, Public Library of Science, USA. ISSN 1932-6203, 2012, vol. 2012.
SCHIMEK, Michael G. - MYSICKOVA, Alena - BUDINSKÁ, Eva.
An Inference and Integration Approach for the Consolidation of Ranked Lists. COMMUNICATIONS IN STATISTICS-SIMULATION AND COMPUTATION, PHILADELPHIA, TAYLOR & FRANCIS INC, USA. ISSN 0361-0918, 2012, vol. 41, no. 7, pp. 1152-1166.
ANGHEL, Silvia I. - CORREA-ROCHAL, Rafael - BUDINSKÁ, Eva - BOLIGANL, Kayluz F. - ABRAHAM, Shahnaz - COLOMBETTI, Sara - FONTAO, Lionel - MARIOTTI, Agnese - RIMOLDI, Donata - GHANEM, Ghanem E. - FISHER, David E. - LÉVY, Frederic - DELORENZI, Mauro - PIGUET, Vincent.
Breast cancer suppressor candidate-1 (BCSC-1) is a melanoma tumor suppressor that down regulates MITF. Pigment Cell & Melanoma Research, HOBOKEN, WILEY-BLACKWELL, USA. ISSN 1755-1471, 2012, vol. 25, no. 4, pp. 482-487.
KRYUKOV, Fedor - NĚMEC, Pavel - DEMENTYEVA, Elena Vladimirovna - KUBICZKOVÁ, Lenka - IHNATOVÁ, Ivana - BUDINSKÁ, Eva - JARKOVSKÝ, Jiří - ŠEVČÍKOVÁ, Sabina - KUGLÍK, Petr - HÁJEK, Roman.
Determining of molecular signature for centrosome abnormalities in multiple myeloma. 2012.
POPOVICI, Vlad - BUDINSKÁ, Eva - TEJPAR, Sabine - WEINRICH, Scott - ESTRELLA, Heather - HODGSON, Graeme - VAN CUTSEM, Eric - XIE, Tao - BOSMAN, Fred - ROTH, Arnaud - DELORENZI, Mauro.
Identification of a Poor-Prognosis BRAF-Mutant Like Population of Patients With Colon Cancer. Journal of Clinical Oncology, 30(12):12BB-1295, 2012. Journal of Clinical Oncology. 2012, vol. 30(12), p. 1288-1295.
BOUCHAL, Pavel - DVOŘÁKOVÁ, Monika - ROUMELIOTIS, Theodoros - BORTLÍČEK, Zbyněk - IHNATOVÁ, Ivana - HO, Jenny - STRUHÁROVÁ, Iva - BUDINSKÁ, Eva - VYZULA, Rostislav - GARBIS, Spiros D. - VOJTĚŠEK, Bořivoj - NENUTIL, Rudolf.
Molecular players in lymph node metastasis of low grade breast cancer: From proteomics-based target discovery to functional characterization. 2012.
BOUCHAL, Pavel - DVOŘÁKOVÁ, Monika - ROUMELIOTIS, Theodoros - STRUHÁROVÁ, Iva - BUDINSKÁ, Eva - BORTLÍČEK, Zbyněk - LENČO, Juraj - GARBIS, Spiros D. - NENUTIL, Rudolf - VOJTĚŠEK, Bořivoj.
Molekulární mechanismy metastazování u low-grade karcinomů prsu: Od proteomického profilování k funkční charakterizaci. 2012.
ZDRAŽILOVÁ DUBSKÁ, Lenka - VALÍK, Dalibor - BUDINSKÁ, Eva - FRGALA, Tomáš - BAČÍKOVÁ, Libuše - DEMLOVÁ, Regina.
NKT-like Cells are Expanded in Solid Tumour Patients. Klinická onkologie, Praha, Česká lékařská společnost J.E.Purkyně. ISSN 0862-495X, 2012, vol. 2012, no. 2, pp. 2S21-2S25.
VYBÍHAL, Václav - SVOBODA, Tomáš - PROCHÁZKA, Vladimír - BENDA, Petr - HANOUN, George - SMRČKA, Martin - KALA, Zdeněk - BUDINSKÁ, Eva - BOHATÁ, Šárka.
Srovnání laparotomické a laparoskopické techniky při implantaci peritoneální části shuntu v terapii hydrocefalu. Rozhledy v chirurgii, Praha, Česká lékařská společnost J.E.Purkyně. ISSN 0035-9351, 2012, vol. 91, no. 6, pp. 305-310.
DUŠEK, Ladislav - MÁJEK, Ondřej - PAVLÍK, Tomáš - MUŽÍK, Jan - KOPTÍKOVÁ, Jana - BUDINSKÁ, Eva.
Analýza mnohorozměrných dat ve věku personalizované medicíny: trendy a dostupnost pro klinickou praxi. Lékař a technika. ISSN 0301-5491, 2011, vol. 41, no. 1, pp. 5-14.
CORREA-ROCHA, R - ANGHEL, SI - BUDINSKÁ, Eva - BOLIGAN, KF - ABRAHAM, S - COLOMBETTI, S - FONTAO, L - MARIOTTI, A - RIMOLDI, D - GHANEM, GE - FISHER, DE - BRACCO, L - LEVY, F - DELORENZI, M - PIGUET, V.
Global analysis of transcription reveals BCSC-1 as a melanoma tumor suppressor that downregulates MITF. 2011.
PICARD, Franck - LEBARBIER, Emily - BUDINSKÁ, Eva - ROBIN, Stephane.
Joint segmentation of multivariate Gaussian processes using mixed linear models. Computational Statistics & Data Analysis, ELSEVIER, Great Britain. ISSN 0167-9473, 2011, vol. 55, no. 2, pp. 1160-1170.
POPOVICI, Vlad - BUDINSKÁ, Eva - DELORENZI, Mauro.
Rgtsp: a generalized top scoring pairs package for class prediction. Bioinformatics, Great Britain. ISSN 1367-4803, 2011, vol. 27, no. 12, 1729–1730-2 pp.
POPOVICI, Vlad - BUDINSKÁ, Eva - DELORENZI, Mauro.
Rgtsp: a generalized top scoring pairs package for class prediction. Bioinformatics, Oxford, Oxford University Press. ISSN 1367-4803, 2011, vol. 27, no. 12, pp. 1729-1730.
BUDINSKÁ, Eva - BORTLÍČEK, Zbyněk - DUŠEK, Ladislav.
Současné trendy v analýze genomických dat. Lékař a technika. ISSN 0301-5491, 2011, vol. 2011.
VAŠÍKOVÁ, Alžbeta - BELIČKOVÁ, Monika - BUDINSKÁ, Eva - ČERMÁK, Jaroslav.
A distinct expression of various gene subsets in CD34+ cells from patients with early and advanced myelodysplastic syndrome. Leukemia Research, USA. ISSN 0145-2126, 2010, vol. 34, no. 12, pp. 1566-1572.
BOUCHAL, Pavel - MUDROCHOVÁ, Monika - BORTLÍČEK, Zbyněk - ROUMELIOTIS, Theodoros - BUDINSKÁ, Eva - VÁŇOVÁ, Dominika - HERNYCHOVÁ, Lenka - STRUHÁROVÁ, Iva - HRSTKA, Roman - MÜLLER, Petr - SCHERL, Alexander - GARBIS, Spiros D. - NENUTIL, Rudolf - VOJTĚŠEK, Bořivoj.
Biomarker discovery in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach. 2010. ISBN 978-80-86793-16-0.
BOUCHAL, Pavel - MUDROCHOVÁ, Monika - BUDINSKÁ, Eva - BORTLÍČEK, Zbyněk - STRUHÁROVÁ, Iva - HERNYCHOVÁ, Lenka - ROUMELIOTIS, Theodoros - GARBIS, Spiros D. - HRSTKA, Roman - MÜLLER, Petr - NENUTIL, Rudolf - VOJTĚŠEK, Bořivoj.
Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach. 2010. ISBN 978-80-88866-83-1.
JEDLIČKOVÁ, Hana - HLUBINKA, Miloslav - PAVLÍK, Tomáš - SEMRÁDOVÁ, Věra - BUDINSKÁ, Eva - VLAŠÍN, Zdeněk.
Bullous pemphigoid and internal diseases: A case-control study. European Journal of Dermatology, Francie, John Libbey Eurotext, France. ISSN 1167-1122, 2010, vol. 20, no. 1, pp. 96-101.
JAKUBCOVÁ, Radka - FOUKAL, Jakub - BENDA, Karel - BUDINSKÁ, Eva - MOULIS, Mojmír - ŠÁLEK, David.
Contrast-enhanced ultrasound of peripheral lymph nodes. 2010.
VAVŘÍKOVÁ, Markéta - BARTUŠEK, Daniel - VÁLEK, Vlastimil - HUSTÝ, Jakub - BUDINSKÁ, Eva.
Dependence of the clinical symptoms on the ultrasound findings by patients with celiac disease – prospective study. 2010.
BARTUŠEK, Daniel - VAVŘÍKOVÁ, Markéta - PETRÁŠOVÁ, Hana - VÁLEK, Vlastimil - DOLINA, Jiří - BUDINSKÁ, Eva.
Determination of accuracy of the transit time with respect to defecography in the diagnosis of anorectal dysfunction: use in practice. 2010.
TEJPAR, Sabine - POPOVICI, Vlad - DELORENZI, Mauro - BUDINSKA, Eva - ESTRELLA, Heather - MAO, M - WEINRICH, Scott - YAN, P - VAN CUTSEM, Eric - ROTH, Arnaud.
MUTANT KRAS AND BRAF GENE EXPRESSION PROFILES IN COLORECTAL CANCER: RESULTS OF THE TRANSLATIONAL STUDY ON THE PETACC 3-EORTC 40993-SAKK 60-00 TRIAL. 2010.
POPOVICI, Vlad - BUDINSKA, Eva - DELORENZI, Mauro.
Networks of generalized top scoring pairs for robust phenotype classification. 2010.
BUDINSKA, Eva - DELORENZI, Mauro - DE ROOCK, Wendy - JACOBS, Bart - WALKER, Steven - WILSON, Claire - DAVISON, Timothy - KENNEDY, Richard D. - TEJPAR, Sabine.
New insights to gene expression signatures from primary FFPE tumors for the prediction of response to cetuximab in KRAS and BRAF wild-type colorectal cancer (CRC). 2010.
VAVŘÍKOVÁ, Markéta - BARTUŠEK, Daniel - VÁLEK, Vlastimil - HUSTÝ, Jakub - UTĚŠENÝ, Jaroslav - DOLINA, Jiří - BUDINSKÁ, Eva.
Spleen size in patients with celiac disease - prospective study. 2010.
BOUCHAL, Pavel - STRUHÁROVÁ, Iva - BUDINSKÁ, Eva - ŠEDO, Ondrej - VYHLÍDALOVÁ, Tereza - ZDRÁHAL, Zbyněk - VAN SPANNING, Rob - KUČERA, Igor.
Unraveling an FNR based regulatory circuit in Paracoccus denitrificans using a proteomics-based approach. Biochimica et Biophysica Acta - Proteins and Proteomics, Amsterdam, The Netherlands, Elsevier, The Nederlands. ISSN 1570-9639, 2010, vol. 1804, no. 6, pp. 1309-1316.
BUDINSKA, Eva - POPOVICI, Vlad - DELORENZI, Mauro.
Unveiling heterogeneity of stage II and stage III colorectal cancer by defining molecular subtypes. 2010.
SCHIMEK, Michael - BUDINSKA, Eva.
Visualization Techniques for the Integration of Rank Data. In COMPSTAT 2010. Proceedings in Computational Statistics. Heidelberg : Physica, 2010. ISBN 978-3-7908-2603-6, p. 1637 - 1644. 2010, Paris, France.
BUDINSKA, Eva - FOJT, Otakar - DUŠEK, Ladislav.
Bioinformatics in Genomics and Proteomics Data. 2009. CZE, Brno, Česká republika. 25.11.2009 - 27.11.2009, European Activity.
BUDINSKA, Eva - BORTLÍČEK, Zbyněk.
E-learning in genomic and proteomic data analysis. 2009.
BESZÉDESOVÁ, Natália - BUDINSKÁ, Eva - SKORKOVSKÁ, Šárka.
Funkčná integrita neurosenzorickej sietnice u diabetikov 2. typu. Česká a slovenská oftalmologie. ISSN 1211-9059, 2009, vol. 65, no. 4, pp. 124-30.
SCHIMEK, Michael G. - BUDINSKÁ, Eva - LIN, S - MYSICKOVA, Alena.
Inference, aggregation and graphics for top-k rank lists. In useR! Abstracts. Rennes, France : 2009. Rennes, France.
SCHIMEK, Michael G. - BUDINSKÁ, Eva - MYSICKOVA, Alena.
Integration of top-k list information inferred from paired rankings. In Proceedings of the 6th St. Petersburg Workshop on Simulation. St. Petersburg : 2009. ISBN 978-5-9651-0354-6, p. 541-546. 2009, St. Petersburg, Russia.
BUDINSKÁ, Eva - GELNAROVÁ, Eva - SCHIMEK, Michael G..
MSMAD: a computationally efficient method for the analysis of noisy array CGH data. Bioinformatics, Oxford University Press, Great Britain. ISSN 1367-4803, 2009, vol. 25, no. 6, pp. 703-713.
LAKOMÝ, Radek - GREPLOVÁ, Kristína - PILNÝ, Radomír - BUDINSKÁ, Eva - VALÍK, Dalibor - POPRACH, Alexandr - NĚMEČEK, Radek - VYZULA, Rostislav.
Profily nízkomolekulárního proteomového spektra získané pomocí hmotnostní spektrometrie SELDI-TOF v sérech pacientů s diseminovaným maligním melanomem: pilotní studie. Klinická onkologie, Brno, . ISSN 0862-495X, 2009, vol. 22, no. 5, pp. 228-232.
BOUCHAL, Pavel - STRUHÁROVÁ, Iva - BUDINSKÁ, Eva - ŠEDO, Ondrej - VYHLÍDALOVÁ, Tereza - ZDRÁHAL, Zbyněk - VAN SPANNING, Rob - KUČERA, Igor.
The study on Fnr-type transcription regulators functions in bacterium Paracoccus denitrificans using proteomics, transcriptomics and bioinformatics tools. 2009.
BOUCHAL, Pavel - STRUHÁROVÁ, Iva - BUDINSKÁ, Eva - ŠEDO, Ondrej - VYHLÍDALOVÁ, Tereza - ZDRÁHAL, Zbyněk - VAN SPANNING, Rob - KUČERA, Igor.
Unraveling a FNR-based regulatory circuit in bacterium Paracoccus denitrificans using proteomics, transcriptomic and bioinformatic approaches. 2009.
JAKUBCOVÁ, Radka - FOUKAL, Jakub - BUDINSKÁ, Eva - ŠMARDOVÁ, Lenka.
Využití kontrastního ultrazvukového vyšetření v diferenciální diagnostice lymfadenopatií - první zkušenosti. Česká radiologie, Praha, Galén. ISSN 1210-7883, 2009, vol. 63, no. 1, pp. 48-55.
GREPLOVÁ, Kristína - PILNÝ, Radomír - BUDINSKÁ, Eva - DUBSKÁ, Lenka - LAKOMÝ, Radek - VYZULA, Rostislav - VOJTĚŠEK, Bořivoj - VALÍK, Dalibor.
When one chip is not enough: Augmenting the validity of SELDI-TOF proteomic profiles of clinical specimens. Lab on a Chip. ISSN 1473-0197, 2009, vol. 2009, no. 9, pp. 1014 - 1017.
ŠEBKOVÁ, Alena - KARASOVÁ, Daniela - CRHÁNOVÁ, Magdaléna - BUDINSKÁ, Eva - RYCHLÍK, Ivan.
aro Mutations in Salmonella enterica Cause Defects in Cell Wall and Outer Membrane Integrity. JOURNAL OF BACTERIOLOGY, American Society for Microbiology, USA. ISSN 0021-9193, 2008, vol. 190, no. 9, pp. 3155-3160.
BROŽKOVÁ, Kristýna - BUDINSKÁ, Eva - BOUCHAL, Pavel - HERNYCHOVÁ, Lenka - KNOFLÍČKOVÁ, Dana - VALÍK, Dalibor - VYZULA, Rostislav - VOJTĚŠEK, Bořivoj - NENUTIL, Rudolf.
Surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight proteomic profiling of breast carcinomas identifies clinicopathologically relevant groups of patients similar to previously defined clusters from cDNA expression. Breast Cancer Research, London, Great Britain, Biomed Central Ltd., Great Britain. ISSN 1465-5411, 2008, vol. 10, no. 3, R48-11 pp.
JARKOVSKÝ, Jiří - PAVLÍK, Tomáš - BUDINSKÁ, Eva - GELNAROVÁ, Eva - KUBOŠOVÁ, Klára.
Data mining ve výuce klinických a zdravotnických oborů. 2007.
MATIASOVICOVA, J. - ADAMS, P. - BARROW, P.A. - HRADECKÁ, Helena - MALCOVA, M. - KARPISKOVA, R. - BUDINSKÁ, Eva - PILOUSOVÁ, Lenka.
Identification of putative ancestors of the multidrug-resistant Salmonella enterica serovar typhimurium DT104 clone harboring the Salmonella genomic island 1. Archives of microbiology. ISSN 0302-8933, 2007, vol. 187, no. 5, pp. 415-424.
BUDINSKÁ, Eva - JAROŠOVÁ, Marie - POSPÍŠILOVÁ, Helena.
Pitfalls and quests of DNA microarray data analysis: case study on patiens with DLBCL lymphoma. In Book of Abstracts. International Conference. Analytical Cytometry IV. Brno : Czech Society for Analytical Cytology, 2007. ISBN 978-80-239-9591-6, p. 18-18.
PAVLÍK, Tomáš - BUDINSKÁ, Eva - DUŠEK, Ladislav - JARKOVSKÝ, Jiří.
Robustní metody hodnocení genových expresních dat. In Trendy v biomedicínském inženýrství. Kladno: ČVUT v Praze. Praha : České vysoké učení technické v Praze, 2007. ISBN 978-80-01-03777-5, pp. 252-254. 2007, Kladno.
VRANOVÁ, Vladimíra - NEČESALOVÁ, Eva - KUGLÍK, Petr - CEJPEK, Pavel - PEŠÁKOVÁ, Martina - BUDINSKÁ, Eva - RELICHOVÁ, Jiřina - VESELSKÁ, Renata.
Screening of genomic imbalances in glioblastoma multiforme using high-resolution comparative genomic hybridization. Oncology Reports. ISSN 1021-335X, 2007, vol. 17, no. 2, pp. 457-464.
BUDINSKÁ, Eva - JARKOVSKÝ, Jiří.
Metody detekce alterovaných oblastí DNA z dat CGH arrays. Klinická onkologie, Supplementum, BRNO, ApS BRNO, spol. s r. o. ISSN 0862-495X, 2006, vol. 19, no. Prosinec, pp. 368-372.
BUDINSKÁ, Eva - GELNAROVÁ, Eva.
A Method for Detecting Breakpoints in Array CGH data. In EnviroInfo Brno 2005. Networking Environmental Information. Part 2. Proceedings of the 19th International Conference Informatics for Environmental Protection. Brno : Masaryk University in Brno, 2005. ISBN 80-210-3780-6, pp. 673 - 676. 7.9.2005, Brno.
JARKOVSKÝ, Jiří - BUDINSKÁ, Eva - DUŠEK, Ladislav.
Analýza expresních microarrays: zjednodušení datové struktury, klasifikace a ordinace. In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. ISBN 80-239-5155-6 : Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005. ISBN 80-239-5155-6, pp. 105-106. 21.6.2005, Červenohorské sedlo.
BUDINSKÁ, Eva - JARKOVSKÝ, Jiří - DUŠEK, Ladislav.
CGH microarrays: detekcia "zlomov" v genóme. In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. Brno : Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005. ISBN 80-239-5155-6, pp. 103-104. 21.6.2005, Červenohorské sedlo.
BUDINSKÁ, Eva - JARKOVSKÝ, Jiří - LIDMAN, Petr - DUŠEK, Ladislav.
Komplexní analýza údajů z genových expresních map: výzva onkologického výskumu pro současnou analýzu dat. In Edukační sborník. XXIX. Brněnské onkologické dny s XIX. Konferencí pro sestry a laboranty. 26.- 28.května 2005. Brno : Masarykův onkologický ústav, 2005. ISBN 80-86793-05-2, pp. 83-85. 26.5.2005, Brno.
MATIAŠOVICOVÁ, J. - HRADECKÁ, H. - ADAMS, P. - BARROW, P. - BUDINSKÁ, E. - RYCHLÍK, I..
Microarray analýza genomu Salmonella enerica serovar Typhimurium. In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. : Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005. ISBN 80-239-5155-6, p. 118-118. 21.6.2005, Červenohorské sedlo.
LIDMAN, Petr - STANÍČEK, Zdenko - PROCHÁZKA, Filip - BUDINSKÁ, Eva - JARKOVSKÝ, Jiří - DUŠEK, Ladislav.
Projekt EMIL (Effective Microarray IntelLigence): přínos metod umělé inteligence pro analýzu microarrays. In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. Brno : Česká společnost pro analytickou cytologii, 2005. ISBN 80-239-5155-6, pp. 107-108. 21.6.2005, Červenohorské sedlo.
LIDMAN, Petr - STANÍČEK, Zdenko - PROCHÁZKA, Filip - DUŠEK, Ladislav - JARKOVSKÝ, Jiří - BUDINSKÁ, Eva.
Rule-based systems: employing intelligent computer assistant in biomedicine & clinical practice. In Proceedings of 1st International Summer School on Computational Biology. Brno : Masarykova univerzita, 2005. ISBN 80-210-3907-8, pp. 100-104. 4.9.2005, Brno.
BUDINSKÁ, Eva - JARKOVSKÝ, Jiří - DUŠEK, Ladislav.
Úvod do analýzy a designu DNA microarrays. In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. Brno : Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005. ISBN 80-239-5155-6, pp. 99-100. 21.6.2005, Červenohorské sedlo.
JAROŠOVÁ, M. - POSPÍŠILOVÁ, H. - PLACHÝ, R. - BUDINSKÁ, E. - DIVOKÁ, M. - HOLZEROVÁ, M. - LAKOMÁ, I. - PAPAJÍK, T. - SZOTKOWSKI, T. - PIKALOVÁ, Z. - MIHÁL, V. - INDRÁK, K..
Výsledky studie ArrayCGH u nemocných s akutní leukemií s normálním karyotypem. In Sborník abstraktů konference se zahraniční účastí. Analytická cytometrie III. : Česká společnosti pro analytickou cytologii, 2005. ISBN 80-239-5155-6, pp. 110-111. 21.6.2005, Červenohorské sedlo.
