Narodil se 1. listopadu 1871 ve Voticích jako syn lékárníka. Po promoci na Lékařské fakultě KU v Praze v r. 1896 se věnoval praktické medicíně; působil mj. jako praktický lékař v Pelhřimově. Od roku 1900 pak pracoval jako asistent na anatomickém ústavě Lékařské fakulty v Praze. Věnoval se zejména pracím ze srovnávací embryologie savců a ptáků. Po pěti letech se habilitoval z normální a srovnávací anatomie, od r. 1909 byl mimořádným profesorem. V roce 1911 se také habilitoval z oboru anatomie domácích zvířat na Vysoké škole technické v Praze. V r. 1919 byl činný jako jeden z prvních pěti řádných profesorů na LF MU, kde se stal přednostou anatomického ústavu a obdobný ústav budoval také na Vysoké škole zvěrolékařské v Brně. Pro ni zřídila LF samostatnou veterinární pitevnu. V letech 1919/20 byl prorektorem a v letech 1921/22 rektorem Vysoké školy zvěrolékařské v Brně, v letech 1920/21 byl děkanem LF MU, 1921/1922 proděkanem. Značnou pozornost věnoval návrhům na reformu lékařského studia. Pro výkon funkce rektora MU měl tedy vynikající předchozí zkušenosti. Jako rektor se zabýval řešením složitého vztahu univerzity a lékařské fakulty k výstavbě Domu útěchy v Brně. Velmi se zasloužil o organizaci a rozvoj vysokoškolského sportu na univerzitě a v Brně vůbec. V roce 1938 byl prof. Völker penzionován. Po druhé světové válce (od května 1945) vykonával prozatimní funkci děkana a i po odchodu do výslužby (31. 12. 1945) přednášel ještě do roku 1950 jako honorární profesor kapitoly z anatomie a úvod do studia lékařství. Ač uzavřené povahy, patřil k oblíbeným přednášejícím a k osobnostem s vysokou osobní prestiží, která obětovala fakultě a univerzitě všechny síly; vybudoval brněnskou anatomickou školu. Zemřel ve Svitávce 26. října 1955.

Jan Šmarda, Karel Linhart. Prof. MUDr. et MVDr. h. c. Otomar Völker – rektor 1928–1929. (Galerie rektorů naší univerzity. II. Lékaři). Universitas. Revue Masarykovy univerzity v Brně. 3/1994, s. 46-47.