Informace o projektu
Mapování výskytu makrolidové rezistence původce syfilis v ČR a molekulární typizace jednotlivých syfilitických kmenů
- Kód projektu
- NT11159
- Období řešení
- 9/2010 - 12/2014
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Ministerstvo zdravotnictví ČR
- Resortní program výzkumu a vývoje - MZ III. na léta 2010 - 2015 (IGA)
- Fakulta / Pracoviště MU
- Lékařská fakulta
- Spolupracující organizace
-
Státní zdravotní ústav Praha 10 - Vinohrady
- Odpovědná osoba Ing. Jana Kalinová, Ph.D.
Celogenomová sekvenace několika kmenů Treponema pallidum (TP, t.j. kmenů
Nichols, SS14, Mexico A a DAL-1) umožnila vývoj vysoce specifické PCR
diagnostiky TP. PCR detekce treponemální DNA umožňuje identifikovat
kmenově specifické genomové sekvence a také geneticky vyšetřovat citlivost
na některá antibiotika. Cílem projektu je sběr klinických vzorků z ČR a to
zejména anogenitálních stěrů a vzorků plné krve. Z těchto vzorků budeme
izolovat treponemální DNA, kterou budeme po amplifikaci sekvenovat (ve
variabilních chromosomálních lokusech). Navíc budeme molekulárně
biologicky určovat rezistenci k makrolidovým antibiotikům a klindamycinu.
Sekvence získané z různých izolátů TP budou srovnány a profil
jednonukleotidových záměn, delecí a inzercí bude využit pro shlukovací
analýzu treponemálních izolátů a pro epidemiologické účely. Dále budeme
vyvíjet rychlejší a levnější diagnostické testy pro molekulární typizaci
původce syfilis.
Publikace
Počet publikací: 24
2016
-
Treponema pallidum, the syphilis spirochete: making a living as a stealth pathogen
Nature Reviews Microbiology, rok: 2016, ročník: 14, vydání: 12, DOI
2015
-
A Retrospective Study on Genetic Heterogeneity within Treponema Strains: Subpopulations Are Genetically Distinct in a Limited Number of Positions
PLoS Neglected Tropical Diseases, rok: 2015, ročník: 9, vydání: 10, DOI
-
Rezistence původce syfilis, Treponema pallidum subsp. pallidum, k makrolidovým antibiotikům v České republice a ve světě
Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie, rok: 2015, ročník: 64, vydání: 1
-
The 2 simultaneously Published "k" Sequence Variants of tp0548 Locus of Treponema pallidum ssp. pallidum Isolates Differ: The One Published Later Has to Be Renamed as "l"
Sexually Transmitted Diseases, rok: 2015, ročník: 42, vydání: 1, DOI
-
Uncultivable Pathogenic Treponemes
Molecular Medical Microbiology. Vol. 3, vydání: Vyd. 2nd ed., rok: 2015, počet stran: 16 s.
2014
-
Molecular Typing of Treponema pallidum in the Czech Republic during 2011 to 2013: Increased Prevalence of Identified Genotypes and of Isolates with Macrolide Resistance
Journal of Clinical Microbiology, rok: 2014, ročník: 52, vydání: 10, DOI
-
Syphilis-causing strains belong to separate SS14-like or Nichols-like groups as defined by multilocus analysis of 19 Treponema pallidum strains
International Journal of Medical Microbiology, rok: 2014, ročník: 304, vydání: 5-6, DOI
-
The Molecular Typing Data of Recently Identified Subtype 11q/j of Treponema pallidum subsp. pallidum Suggest Imported Case of Yaws.
Sexually transmitted diseases, rok: 2014, ročník: 41, vydání: 9
-
Whole Genome Sequence of the Treponema pallidum subsp. endemicum Strain Bosnia A: The Genome Is Related to Yaws Treponemes but Contains Few Loci Similar to Syphilis Treponemes
PLoS neglected tropical diseases, rok: 2014, ročník: 8, vydání: 11, DOI
2013
-
Cell cycle genes co-expression in multiple myeloma and plasma cell leukemia
Genomics, rok: 2013, ročník: 102, vydání: 4, DOI