Informace o projektu
Charakterizace a funkční diverzita proteinů rodiny SMH, která je specifická pro rostliny
- Kód projektu
- GP521/08/P452
- Období řešení
- 1/2008 - 12/2010
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Postdoktorské projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Přírodovědecká fakulta
- Klíčová slova
- x
Proteiny AtTRB patří do skupiny SMH proteinů, které jsou definovány přítomností Myb domény na svém N-konci, centrální H1/5 doménou a C-koncovou coiled-coil doménou. Proteiny typu SMH jsou specifické pouze pro rostlinnou říši a jejich členové se váží Myb doménou typu telobox nejen na rostlinné telomerické repetice, ale také mohou mít regulační funkci v promotorech jiných genů. Do současné doby byly v naší laboratoři charakterizovány tři proteiny z této skupiny. Ačkoliv byla u všech proteinů prokázána specifická vazba na ds-telomerické repetice a u některých také na G-bohaté vlákno telomerické repetice, v dvojhybridním systému se jednotlivé proteiny významně liší svými interakčními partnery. Cílem tohoto projektu je vyhledat interakční partnery přímo v rostlinném systému pomocí metody TAP-tag, která umožňuje šetrnou dvojkrokovou purifikaci proteinů. Projekt by měl také s použitím ChIP analýzy pomoci vyřešit otázku, zda jsou AtTRB proteiny lokalizovány na telomerách a nebo rozeznávají intersticiální
Publikace
Počet publikací: 13
2011
-
Role of HMGB Proteins in Chromatin Dynamics and Telomere Maintenance in Arabidopsis thaliana
CURRENT PROTEIN & PEPTIDE SCIENCE, rok: 2011, ročník: 12, vydání: 2
-
Using the Telobox to Search for Plant Telomere Binding Proteins
CURRENT PROTEIN & PEPTIDE SCIENCE, rok: 2011, ročník: 12, vydání: 2
2009
-
Application of fluorescence anisotropy to monitor protein binding to telomeric DNA
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
CHROMATIN ASSOCITED HMGB1 PROTEIN IS INVOLVED IN REGULATION OF TELOMERE LENGTHS IN PLANTS
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
-
In vitro translace a imunoprecipitace: problémy a jejich řešení
Bulletin České společnosti experimentální biologie rostlin a Fyziologické sekce Slovenské botanické společnosti, rok: 2009
-
Mechanismus vazby SMH proteinů na telomerickou DNA
Chemické listy, rok: 2009
-
Regulation of telomeres by chromatin associated High Mobility Group Box 1 (HMGB1) protein
Rok: 2009, druh: Konferenční abstrakty
2008
-
Analysis of interaction domains of plant telomere-binding proteins AtTRB1 and AtPOT1b
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty
-
Functional characterization of domains in AtTRB1, a putative telomere-binding protein in Arabidopsis thaliana
Phytochemistry, rok: 2008, ročník: 69, vydání: 9
-
Generation of Specific Antibodies Against Plant Telomere Binding Proteins
Rok: 2008, druh: Konferenční abstrakty