Informace o projektu
Vliv hybridizace a alopolyploidizace na diverzitu ve třech tribech čeledi Brassicaceae
- Kód projektu
- GA19-06632S
- Období řešení
- 1/2019 - 6/2022
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Univerzita Karlova v Praze
- Odpovědná osoba prof. RNDr. Karol Marhold, CSc.
Projekt se zabývá vlivem hybridizace a alopolyploidie při vytváření diverzity na příkladu tří tribů z čeledi Brassicaceae. Věnuje se genomickým, fenotypovým a ekologickým důsledkům vnitro- a meziploidního křížení a zhodnocení jeho významu pro rostliny v jejich přirozeném prostředí. Projekt využívá široké spektrum technik: genomických (RADseq, Hyb-seq target enrichment,
mikrosatelitové markery), in situ hybridizace (GISH, FISH, srovnávací malování chromozómů -CCP), měření obsahu DNA (velikosti genomu), multivariační morfometriky, asistovaná hybridizace a modelování ekologických a klimatických nik. Nespornou výhodou řešitelského kolektivu slibující zdárné řešení projektu je detailní znalost zahrnutých rostlinných systémů
včetně jejich evoluční historie, zkušenost s navrhovanými metodami u studovaných rodů i již sebraný materiál pro analýzy DNA. Příbuznost zkoumaných taxonů modelovému druhu Arabidopsis thaliana usnadňuje použití a interpretaci genomických metodik a zároveň zajišťuje
širokou odezvu publikovaných výsledků.
Publikace
Počet publikací: 3
2021
-
Allele Sorting as a Novel Approach to Resolving the Origin of Allotetraploids Using Hyb-Seq Data: A Case Study of the Balkan Mountain Endemic Cardamine barbaraeoides
Frontiers in Plant Science, rok: 2021, ročník: 12, vydání: April, DOI
-
Novelty and Convergence in Adaptation to Whole Genome Duplication
Molecular Biology and Evolution, rok: 2021, ročník: 38, vydání: 9, DOI
2020
-
So Closely Related and Yet So Different: Strong Contrasts Between the Evolutionary Histories of Species of the Cardamine pratensis Polyploid Complex in Central Europe
Frontiers in Plant Science, rok: 2020, ročník: 11, vydání: December 2020, DOI