Informace o projektu
Neuspořádanost proteinových struktur vnáší řád do bakteriální transkripce
- Kód projektu
- GA22-12023S
- Období řešení
- 1/2022 - 12/2024
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Grantová agentura ČR
- Standardní projekty
- Fakulta / Pracoviště MU
- Středoevropský technologický institut
- Spolupracující organizace
-
Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i.
- Odpovědná osoba Mgr. Libor Krásný, Ph.D.
Naše znalost přirozeně neuspořádaných proteinů je dosud v počátcích. Podjednotka delta bakteriální RNA polymerasy (RNAP), obsahující přirozeně neuspořádanou C-terminální doménu (CTD), je typickým příkladem takového proteinu. Delta je důležitá pro regulaci transkripce a přežití buněk v kompetitivním prostředí. Navzdory rozsáhlým studiím tohoto proteinu jsou interakce CTD s RNAP a jejich role v transkripci jsou v podstatě neznámé. Navrhujeme (1) určit dosud neznámé struktury iniciačních komplexů RNA s deltou a primárním sigma faktorem (SigA) pomocí kryoelektronové mikroskopie (EM), (2) strukturně charakterizovat deltu S. aureus, jejíž sekvence je unikátní vzhledem k ostatním druhům a (3) popsat dynamiku, intermolekulární interakce a následně roli CTD delty v iniciačních komplexech obsahujících RNAP-SigA pomocí nukleární magnetické rezonance a(nebo) kryo-EM. Tato studie tak přinese naléhavě potřebnou informaci o funkci přirozeně neuspořádaných proteinů v klíčovém procesu transkripce.
Cíle udržitelného rozvoje
Masarykova univerzita se hlásí k cílům udržitelného rozvoje OSN, jejichž záměrem je do roku 2030 zlepšit podmínky a kvalitu života na naší planetě.
Publikace
Počet publikací: 3
2023
-
Characterisation of invisible conformation of domain 1.1 of σA factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis
Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty
-
Characterization of a transitionally occupied state and thermal unfolding of domain 1.1 of σ A factor of RNA polymerase from Bacillus subtilis
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics, rok: 2023, ročník: 91, vydání: 9, DOI
-
Study of the Dynamics of Flexible Subunits of RNA Polymerase from Bacillus subtilis
Rok: 2023, druh: Vyžádané přednášky