Informace o publikaci
Bioinformatické vyhledávání lektinů z hub a plísní
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2008 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | XXI. biochemický sjezd, program, sborník přednášek a posterů |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Biochemie |
| Klíčová slova | lectins; bioinformatics; |
| Popis | Lektiny jsou proteiny nebo glykoproteiny neimunitního původu schopné rozpoznávat a reverzibilně vázat různé sacharidové struktury. Tato práce se zabývá bioinformatickým vyhledáváním a analýzou lektinů z hub a plísní. Na základě sekvenční podobnosti byly identifikovány houbové proteiny podobné známým lektinům. Pro nalezené potenciální lektiny a proteiny s lektinovou doménou byla predikována 3D struktura. Většina proteinů vykazovala strukturní podobnost s lektiny zařazenými do některé z rodin houbových lektinů (A. aurantia, C. cinereus, P. cornucopiae, F. velutipes a ricinová rodina) a je pravděpodobné, že se jedná o nové zástupce těchto rodin. Dále byly nalezeny houbové proteiny podobné lektinům z L. sulphureus, S. sclerotiorum a P. velutina a rostlinným mannosa-specifickým lektinům. |
| Související projekty: |