FastGrid -- The Accelerated Computation of Potential Maps for Molecular Docking

• Název česky: FastGrid -- akcelerovaný výpočet potenciálových map pro molekulový docking
• Autoři: OLŠÁK Marek; FILIPOVIČ Jiří; PROKOP Martin
• Rok publikování: 2009
• Druh: Software
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• www: http://code.google.com/p/fastgrid/
• Popis: FastGrid je fork AutoGridu, který slouží k výpočtu map interakčních energií v okolí makromolekuly pro různé typy atomů. Tyto mapy jsou následně použity programem AutoDock pro výpočet celkové energie komplexu ligand-makromolekula. FastGrid je náhrada AutoGridu, která vykazuje obdobné chování jako AutoGrid 4.2.1 a je více než 100x rychlejší v závislosti na velikosti molekuly a map.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Vysoce paralelní a distribuované výpočetní systémy