Mechanismus vazby SMH proteinů na telomerickou DNA

• Authors: ZIMMERMANN Michal; HOFR Ctirad; ŠULTESOVÁ Pavla; MOZGOVÁ Iva; PROCHÁZKOVÁ SCHRUMPFOVÁ Petra; FAJKUS Jiří
• Year of publication: 2009
• Type: Article in Proceedings
• Conference: Chemické listy
• MU Faculty or unit: Faculty of Science
• Field: Genetics and molecular biology
• Keywords: Protein-DNA interaction; Arabidopsis thaliana; SMH protein; fluorescence anisotropy; electrophoretic mobility shift assay
• Description: Náplní práce je kvantitativní popis interakcí DNA a SMH proteinů AtTRB1 a AtTRB3 in vitro. Pomocí spektroskopického měření anizotropie fluorescence a gelové retardační analýzy byla stanovena stechiometrie vazby a afinita proteinů AtTRB k DNA o různém počtu telomerických repetic. Měření afinity za podmínek různé iontové síly umožnilo určit podíl specifických interakcí na tvorbě komplexu. Na základě získaných výsledků byl nově navržen možný funkční model vytváření komplexu proteinů AtTRB a telomerové DNA.

Related projects

• Molecular basis of cell and tissue regulations
• Molecular mechanisms of the cell proliferation and differentiation
• Characterisation of functional diversity of the plant-specific SMH family of proteins