Mgr. et Mgr. Jaroslav Oľha, Ph.D.

2024

• AlphaFind: discover structure similarity across the proteome in AlphaFold DB

  PROCHÁZKA David SLANINÁKOVÁ Terézia OĽHA Jaroslav ROŠINEC Adrián GREŠOVÁ Katarína JÁNOŠOVÁ Miriama ČILLÍK Jakub PORUBSKÁ Jana SVOBODOVÁ Radka DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: W1, DOI

• GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Projekty výzkumu a vývoje

  Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje

• LMI-10: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Projekty výzkumu a vývoje

  Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje

• LMI-30: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Projekty výzkumu a vývoje

  Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje

2023

• Reproducible experiments with Learned Metric Index Framework

  SLANINÁKOVÁ Terézia ANTOL Matej OĽHA Jaroslav DOHNAL Vlastislav LADRA Susana MARTÍNEZ-PRIETO Miguel A.

  Článek v odborném periodiku

  Information systems, rok: 2023, ročník: 118, vydání: 1, DOI

• SISAP 2023 Indexing Challenge – Learned Metric Index

  SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David ANTOL Matej OĽHA Jaroslav DOHNAL Vlastislav

  Článek ve sborníku

  Similarity Search and Applications. SISAP 2023. Lecture Notes in Computer Science, vol 14289, rok: 2023

• Umpalumpa: a framework for efficient execution of complex image processing workloads on heterogeneous nodes

  STŘELÁK David MYŠKA David PETROVIČ Filip POLÁK Jan OĽHA Jaroslav FILIPOVIČ Jiří

  Článek v odborném periodiku

  Computing, rok: 2023, ročník: 105, vydání: 11, DOI

2022

• Learned Indexing in Proteins: Extended Work on Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques

  OĽHA Jaroslav SLANINÁKOVÁ Terézia GENDIAR Martin ANTOL Matej DOHNAL Vlastislav

  Výzkumná zpráva

  Rok: 2022

• Learned Indexing in Proteins: Substituting Complex Distance Calculations with Embedding and Clustering Techniques

  OĽHA Jaroslav SLANINÁKOVÁ Terézia GENDIAR Martin ANTOL Matej DOHNAL Vlastislav

  Článek ve sborníku

  Similarity Search and Applications, 15th International Conference, SISAP 2022, Bologna, Italy, October 5–7, 2022, Proceedings, rok: 2022

• Property Map Collective Variable as a Useful Tool for a Force Field Correction

  TRAPL Dalibor KRUPIČKA MArtin VIŠŇOVSKÝ Vladimír HOZZOVÁ Jana OĽHA Jaroslav KŘENEK Aleš SPIWOK Vojtěch

  Článek v odborném periodiku

  Journal of Chemical Information and Modeling, rok: 2022, ročník: 62, vydání: 3, DOI