RNDr. Lukáš Hejtmánek, Ph.D.

2026

• AlphaFind v2: Similarity Search in AlphaFold DB and TED Domains across Structural Contexts - data

  SLANINÁKOVÁ Terézia ROŠINEC Adrián ČILLÍK Jakub KŘENEK Aleš GREŠOVÁ Katarína PORUBSKÁ Jana MARŠÁLKOVÁ Eva OĽHA Jaroslav PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš DOHNAL Vlastislav BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2026, druh: Specializovaná databáze

• Kubernetes Scheduling with Checkpoint/Restore: Challenges and Open Problems

  SPIŠAKOVÁ Viktória STOYANOV Radostin HEJTMÁNEK Lukáš KLUSÁČEK Dalibor REBER Adrian BRUNO Rodrigo

  Článek ve sborníku

  Job Scheduling Strategies for Parallel Processing, rok: 2026

• Opportunistic Resource Reclamation in Kubernetes: From Aggressive Resizing to Flash Jobs

  SPIŠAKOVÁ Viktória STOYANOV Radostin KLUSÁČEK Dalibor HEJTMÁNEK Lukáš

  Článek ve sborníku

  Job Scheduling Strategies for Parallel Processing, rok: 2026

2025

• Caver Web 2.0: analysis of tunnels and ligand transport in dynamic ensembles of proteins

  MARQUES Sérgio Manuel BORKO Simeon VÁVRA Ondřej DVORSKÝ Jan KOHOUT Pavel KABOUREK Petr HEJTMÁNEK Lukáš DAMBORSKÝ Jiří BEDNÁŘ David

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2025, ročník: 53, vydání: W1, DOI

• Reference genomic database of the Czech population

  SVOZILOVÁ Hana PLEVOVÁ Karla BIAGINI Simone Andrea PORC Jakub Paweł HYNŠT Jakub SVATOŇ Jan TICHÝ Boris BYSTRÝ Vojtěch STRANECKY Viktor JIRSOVA Katerina HARTMANNOVA Hana BENDOVA Michaela SROVNAL Josef DRABEK Jiri ROZANKOVA Zuzana KALOUSOVA Marta ZIMA Tomas VACULÍKOVÁ Jana KURUCOVÁ Terézia SIMOVA Jarmila HEJTMÁNEK Lukáš DOUBEK Michael FRANKOVA Vera BENESOVA Lucie UVIROVA Magdalena KMOCH Stanislav MACEK Milan HAJDUCH Marian POSPÍŠILOVÁ Šárka

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2025, druh: Konferenční abstrakty

2024

• 3D-af-Surfer: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze

• 3DZD: Protein structural embeddings of AlphaFold DB v4

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze

• 3DZD: Protein structural embeddings of ESM Atlas

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Projekty výzkumu a vývoje

  Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje

• AlphaFind: Discover structure similarity across the entire known proteome – data and model

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš GREŠOVÁ Katarína OĽHA Jaroslav DOHNAL Vlastislav ROŠINEC Adrián ANTOL Matej

  Specializovaná databáze

  Rok: 2024, druh: Specializovaná databáze

• GraSR: Protein structural embeddings of AlphaFold DB

  NOVOTNÁ Lucie SLANINÁKOVÁ Terézia PROCHÁZKA David HEJTMÁNEK Lukáš ROŠINEC Adrián OĽHA Jaroslav GREŠOVÁ Katarína DOHNAL Vlastislav ANTOL Matej

  Projekty výzkumu a vývoje

  Rok: 2024, druh: Projekty výzkumu a vývoje