Mgr. et Mgr. Adam Midlik, Ph.D.

2023

• Mol* Volumes and Segmentations: visualization and interpretation of cell imaging data alongside macromolecular structure data and biological annotations

  CHARESHNEU Aliaksei MIDLIK Adam IONESCU Crina-Maria ROSE Alexander HORSKÝ Vladimír CANTARA Alessio SVOBODOVÁ Radka BERKA Karel SEHNAL David

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic Acids Research, rok: 2023, ročník: 51, vydání: W1, DOI

2022

• OverProt: secondary structure consensus for protein families

  MIDLIK Adam HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan CHARESHNEU Aliaksei BERKA Karel SVOBODOVÁ Radka

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2022, ročník: 38, vydání: 14, DOI

2021

• 2DProts: database of family-wide protein secondary structure diagrams

  HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan MIDLIK Adam HORSKÝ Vladimír HLADKÁ Eva SVOBODOVÁ Radka BERKA Karel

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2021, ročník: 37, vydání: 23, DOI

• Uncovering of cytochrome P450 anatomy by SecStrAnnotator

  MIDLIK Adam NAVRÁTILOVÁ Veronika MOTURU Tarakaramji KOČA Jaroslav SVOBODOVÁ Radka BERKA K.

  Článek v odborném periodiku

  Nature Scientific Reports, rok: 2021, ročník: 11, vydání: 1, DOI

2020

• Visualization and Analysis of Protein Structures with LiteMol Suite

  SEHNAL David SVOBODOVÁ Radka BERKA K. PRAVDA Lukáš MIDLIK Adam KOČA Jaroslav

  Kapitola v knize

  STRUCTURAL BIOINFORMATICS: METHODS AND PROTOCOLS, rok: 2020, počet stran: 13 s.

2019

• Automated family-wide annotation of secondary structure elements

  MIDLIK Adam HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan MOTURU Tarakaramji NAVRÁTILOVÁ Veronika KOČA Jaroslav BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka

  Kapitola v knize

  Protein supersecondary structures: Methods and protocols, vydání: Vyd. Second Edition, rok: 2019, počet stran: 25 s.

• Creation and visualization of secondary structure consensus for protein families

  MIDLIK Adam HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan NAVRÁTILOVÁ Veronika KOČA Jaroslav BERKA Karel SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2019, druh: Další prezentace na konferencích

• SANGUINARINE IS REDUCED BY NADH THROUGH A COVALENT ADDUCT

  SÁNDOR Roman SLANINA Jiří MIDLIK Adam ŠEBRLOVÁ Kristýna NOVOTNÁ Lucie TÁBORSKÝ Petr TÁBORSKÁ Eva PEŠ Ondřej

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2019, druh: Konferenční abstrakty

2018

• Annotation of protein secondary structure elements for whole protein families

  MIDLIK Adam HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan NAVRÁTILOVÁ Veronika SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav BERKA Karel

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2018, druh: Konferenční abstrakty

• Automated Annotation of Secondary Structure Elements for Entire Protein Families

  MIDLIK Adam HUTAŘOVÁ VAŘEKOVÁ Ivana HUTAŘ Jan MOTURU Tarakaramji NAVRÁTILOVÁ Veronika SVOBODOVÁ VAŘEKOVÁ Radka KOČA Jaroslav BERKA Karel

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2018, druh: Konferenční abstrakty