Informace o projektu

Centrum biologie RNA

Kód projektu
GAP305/12/G034 (kod CEP: GBP305/12/G034)
Období řešení
1/2012 - 12/2018
Investor/Program
Grantová agentura ČR
Programový rámec / typ projektu
Projekty na podporu excelence v základním výzkumu
Fakulta/Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut
Spolupracujici organizace
Akademie věd České republiky

Publikace

2016

Synergy between NMR measurements and MD simulations of protein/RNA complexes: application to the RRMs, the most common RNA recognition motifs

KREPL Miroslav — CLERY Antoine — BLATTER Markus — ALLAIN Frederic H. T. — ŠPONER Jiří

2015

Can We Execute Stable Microsecond-Scale Atomistic Simulations of Protein-RNA Complexes?

KREPL MiroslavHAVRILA MarekSTADLBAUER Petr — BANÁŠ Pavel — OTYEPKA Michal — PASULKA Josef — ŠTEFL RichardŠPONER Jiří

Conformational dynamics of bacterial and human cytoplasmic models of the ribosomal A-site

PANECKA Joanna — ŠPONER Jiří — TRYLSKA Joanna

Microsecond-Scale MD Simulations of HIV-1 DIS Kissing-Loop Complexes Predict Bulged-In Conformation of the Bulged Bases and Reveal Interesting Differences between Available Variants of the AMBER RNA Force Fields

HAVRILA Marek — ZGARBOVÁ Marie — JUREČKA Petr — BANÁŠ Pavel — KREPL MiroslavOTYEPKA MichalŠPONER Jiří

Quantum Chemical Benchmark Study on 46 RNA Backbone Families Using a Dinucleotide Unit

KRUSE Holger — MLÁDEK Arnošt — GKIONIS Konstantinos — HANSEN Andreas — GRIMME Sstefan — ŠPONER Jiří

RBM7 subunit of the NEXT complex binds U-rich sequences and targets 3 '-end extended forms of snRNAs

HROŠŠOVÁ Dominika — ŠIKORSKÝ TomášPOTĚŠIL DavidBARTOŠOVIČ Marek — PASULKA Josef — ZDRÁHAL ZbyněkŠTEFL RichardVAŇÁČOVÁ Štěpánka

Towards biochemically relevant QM computations on nucleic acids: controlled electronic structure geometry optimization of nucleic acid structural motifs using penalty restraint functions

KRUSE Holger — ŠPONER Jiří

2014

Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation

TUDEK Agnieszka — FUERTE Odil Porrua — KABZINSKI Tomasz — LIDSCHREIBER Michael — KUBÍČEK KarelFOŘTOVÁ Andrea — LACROUTE Francoise — VAŇÁČOVÁ Štěpánka — CRAMER Patrick — ŠTEFL Richard — LIBRI Domenico

QM Computations on Complete Nucleic Acids Building Blocks: Analysis of the Sarcin-Ricin RNA Motif Using DFT-D3, HF-3c, PM6-D3H, and MM Approaches

KRUSE Holger — HAVRILA MarekŠPONER Jiří

Role of S-turn2 in the Structure, Dynamics, and Function of Mitochondrial Ribosomal A-Site. A Bioinformatics and Molecular Dynamics Simulation Study

PANECKA Joanna — HAVRILA MarekRÉBLOVÁ KamilaŠPONER Jiří — TRYLSKA Joanna

Předchozí 1 2 3 Další

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info