Informace o projektu

Centrum biologie RNA

Kód projektu
GAP305/12/G034 (kod CEP: GBP305/12/G034)
Období řešení
1/2012 - 12/2018
Investor / Programový rámec / typ projektu
Grantová agentura ČR
Fakulta/Pracoviště MU
Středoevropský technologický institut
Spolupracující organizace
Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.
Odpovědná osoba Mgr. Leoš Valášek Ph.D.
Logo poskytovatele

Publikace

2016

Comparative Assessment of Different RNA Tetranucleotides from the DFT-D3 and Force Field Perspective

SZABLA Rafal — HAVRILA Marek — KRUSE Holger — ŠPONER Jiří

Synergy between NMR measurements and MD simulations of protein/RNA complexes: application to the RRMs, the most common RNA recognition motifs

KREPL Miroslav — CLERY Antoine — BLATTER Markus — ALLAIN Frederic H. T. — ŠPONER Jiří

2015

Can We Execute Stable Microsecond-Scale Atomistic Simulations of Protein-RNA Complexes?

KREPL Miroslav HAVRILA Marek STADLBAUER Petr — BANÁŠ Pavel — OTYEPKA Michal — PASULKA Josef — ŠTEFL Richard ŠPONER Jiří

Conformational dynamics of bacterial and human cytoplasmic models of the ribosomal A-site

PANECKA Joanna — ŠPONER Jiří — TRYLSKA Joanna

Microsecond-Scale MD Simulations of HIV-1 DIS Kissing-Loop Complexes Predict Bulged-In Conformation of the Bulged Bases and Reveal Interesting Differences between Available Variants of the AMBER RNA Force Fields

HAVRILA Marek — ZGARBOVÁ Marie — JUREČKA Petr — BANÁŠ Pavel — KREPL Miroslav OTYEPKA Michal ŠPONER Jiří

Quantum Chemical Benchmark Study on 46 RNA Backbone Families Using a Dinucleotide Unit

KRUSE Holger — MLÁDEK Arnošt — GKIONIS Konstantinos — HANSEN Andreas — GRIMME Sstefan — ŠPONER Jiří

RBM7 subunit of the NEXT complex binds U-rich sequences and targets 3 '-end extended forms of snRNAs

HROŠŠOVÁ Dominika — ŠIKORSKÝ Tomáš POTĚŠIL David BARTOŠOVIČ Marek — PASULKA Josef — ZDRÁHAL Zbyněk ŠTEFL Richard VAŇÁČOVÁ Štěpánka

Towards biochemically relevant QM computations on nucleic acids: controlled electronic structure geometry optimization of nucleic acid structural motifs using penalty restraint functions

KRUSE Holger — ŠPONER Jiří

2014

Molecular Basis for Coordinating Transcription Termination with Noncoding RNA Degradation

TUDEK Agnieszka — FUERTE Odil Porrua — KABZINSKI Tomasz — LIDSCHREIBER Michael — KUBÍČEK Karel FOŘTOVÁ Andrea — LACROUTE Francoise — VAŇÁČOVÁ Štěpánka — CRAMER Patrick — ŠTEFL Richard — LIBRI Domenico

QM Computations on Complete Nucleic Acids Building Blocks: Analysis of the Sarcin-Ricin RNA Motif Using DFT-D3, HF-3c, PM6-D3H, and MM Approaches

KRUSE Holger — HAVRILA Marek ŠPONER Jiří

Předchozí 1 2 3 Další

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info