Informace o projektu
Vývoj vnitřní kontroly pro metagenomické analýzy
- Kód projektu
- TJ02000277
- Období řešení
- 5/2019 - 5/2019
- Investor / Programový rámec / typ projektu
-
Technologická agentura ČR
- ZÉTA
- Fakulta / Pracoviště MU
-
Přírodovědecká fakulta
- Mgr. Petra Vídeňská, Ph.D.
- Spolupracující organizace
-
Pharmaceutical Biotechnology s.r.o.
Cílem projektu je vyvinout prototyp komplexního řešení pro normalizaci analýz lidského mikrobiomu za pomocí užití vnitřní kontroly při sekvenaci genu pro 16S rRNA. K tomuto vedou jednotlivé dílčí cíle:
1. Výběr bakteriálních kmenů o potřebné biologické diverzitě, které se v lidském mikrobiomu nevyskytují a jsou kultivovatelné (08/2019).
2. Podrobná charakterizace a testování vybraných kmenů a příprava funkčních vzorků vnitřních kontrol z vhodných kandidátů (G funkční vzorek, 05/2020).
3. Ověření reprodukovatelnosti a robustnosti jednotlivých funknčních vzorků pomocí sekvenace genu pro 16S rRNA (F užitný vzor, 11/2020).
4. Testování vybrané vnitřní kontroly na reálných vzorcích a vývoj algoritmu pro normalizaci vzorků (odstranění nežádoucích efektů) (G funkční vzorek, 4/2021).