Informace o publikaci

Influence of Trp flipping on carbohydrate binding in lectins. An example on Aleuria aurantia lectin AAL

Autoři

HOUSER Josef KOZMON Stanislav MISHRA Deepti MISHRA Sushil Kumar ROMANO Patrick R WIMMEROVÁ Michaela KOČA Jaroslav

Rok publikování 2017
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Plos one
Fakulta / Pracoviště MU

Středoevropský technologický institut

Citace
www http://journals.plos.org/plosone/article/file?id=10.1371/journal.pone.0189375&type=printable
Doi http://dx.doi.org/10.1371/journal.pone.0189375
Obor Biochemie
Klíčová slova FUCOSE-SPECIFIC LECTIN; DISPERSION INTERACTIONS; CRYSTAL-STRUCTURE; PI INTERACTION; CORE FUCOSE; PROTEIN; APPROXIMATION; ENERGY; RECOGNITION; SPECIFICITY
Popis Interakce protein-cukr jsou často zprostředkovány pomocí CH-pi interakce zahrnující boční řetězec aromatické aminokyseliny. Analýza PDB databáze prokázala tuto interakci pro 265 ligandů a 5208 motivů. Modelový systém interakce je lektinová rodina AAL. V této studii jsme pomocí RTG struktury s vysokým rozlišením a následné in silico analýze prokázali existenci dvou preferovaných konformerů Trp a porovnali jejich výskyt a energetickou bilanci pro vazbu sacharidu.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info