Informace o publikaci
Genetické určení barvy očí u jedinců z pohřebiště Znojmo-Hradiště
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2018 |
| Druh | Článek v odborném periodiku (nerecenzovaný) |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Identifikace individuálních fenotypových charakteristik, nejčastěji barvy vlasů, očí a kůže, se uplatňuje jak ve forenzní praxi, tak ve výzkumu starověké DNA. Existuje několik typů přístupů a protokolů, které lze použít v závislosti na cílech a povaze DNA, která má být vyšetřena na výzkumném vzorku.Hlavním cílem bylo zavedení metody pro detekci polymorfismu rs12913832 genu HERC2, který je považován za nejsilnější marker pro predikci barvy očí. Byla použita real-time PCR s cílovou specifickou sondou TaqMan®, protože se jedná o nejvhodnější metodu pro detekci polymorfismu. Tato předem navržená sonda se vyznačuje velmi krátkou délkou sekvence, což ji činí ideální pro výzkum starověké DNA. Sekvence DNA jsou často velmi krátké kvůli degradaci a fragmentaci. Pro detekci genotypu byla zvolena alelická diskriminace.Pro analýzu byl použit materiál kostry z pohřebiště Znojmo-Hradiště (velkomoravské období). Z celkového souboru 20 vzorků bylo 19 úspěšně analyzováno a genotypováno. Žádný z detekovaných genotypů nebyl identifikován jako homozygotní TT, který je charakteristický pro velmi tmavé odstíny očí. Naproti tomu u většiny vzorků byla detekována heterozygotní sestava. Genotyp TC, který je běžný u jedinců s hnědýma nebo oříškovýma očima, byl stanoven u 15 vzorků. Světlý odstín a odpovídající genotyp CC byly poté stanoveny u 4 jedinců. |