Informace o publikaci
Genomová typizace exfoliatin-pozitivních kmenů <I>Staphylococcus aureus</I>
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2001 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | 22nd Congress of the Czechoslovak Society for Microbiology - Health and Microorganisms |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Popis | Celkem 18 kmenů S. aureus, pocházejících převážně ze dvou nemocnic v ČR, v nichž došlo k hromadnému výskytu toxické epidermolýzy, bylo podrobeno molekulární typizaci. Analýzou polymorfismu délky SmaI re-strikčních fragmentů genomové DNA separovaných pulzní gelovou elektro-forézou byly ET kmeny S. aureus rozděleny do pěti PFGE-typů (ET1 -ET5). EcoRI-ribotypizací bylo stanoveno 7 typů (R1 - R7) a PCR-ribotypizací 4 typy (SP1 - SP4). Hybridizací s molekulární sondou z bakteriofága 53 bylo rozlišeno 5 lyzotypů. DIG-eta-sonda (119 bp) při-pravená ze sekvencí genu pro exfoliatin A umožnila rozlišit 5 typů v restrikčním spektru HindIII DNA fragmentů (HB1 - HB5) a 5 typů ve spektru EcoRI fragmentů (EC1 - EC5). Pomocí PCR byly identifikovány dva geny: gen eta pro exfoliatin A a gen etb pro exfoliatin B vznikem speci-fických amplikonů. U tří kmenů, které tvořily exfoliatin B současně s exfoliatinem A, byla prokázána lokalizace etb genu na plazmidu. Podle počtu shodných zařazení do jednotlivých genotypů byla zjištěna vzájemná podobnost pouze u kmenů majících společný ekologický původ.V jedné lokalitě byly identifikovány dva genotypově shodné kmeny, přičemž každý z nich byl izolován od jiného pacienta. Kmeny pocházející z různých lokalit byly navzájem geneticky odlišné, přestože měly velmi podobné fenotypo-vé vlastnosti. Všechny produkovaly exfoliatiny (A a B), hemolyzin a, byly citlivé k oxacilinu a k fágu 71. |
| Související projekty: |