Cell Nuclei Segmentation Using Star-Shaped Simplex Meshes

• Autoři: MATULA Pavel; SVOBODA David
• Rok publikování: 2002
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: Biophysics of the Genome and Its Interactions
• Fakulta / Pracoviště MU: Fakulta informatiky
• Obor: Využití počítačů, robotika a její aplikace
• Klíčová slova: Cell nuclei segmentation; simplex meshes; deformable models
• Popis: Fast, reliable and precise cell nucleus boundary reconstruction algorithm is needed for automatic measuring of topographical parameters of the large number of cells or cell nuclei. A reconstruction method based on deformation of star-shaped simplex meshes is presented. The method was used for shape reconstruction of cell nuclei of HL-60 cells stained by DAPI (the whole volume of nuclei was visible in the input 3D images) and cell nuclei of HT-29 cells (nuclear envelope, i.e. surface of nucleus boundary, was visualized using Lamin B)

Související projekty

• Jaderná topologie některých protoonkogenů u lidských neutrofilních granulocytů a leukemických buněk
• Vývoj nových diagnostických technik pro onkologii
• Využití počítačové analýzy obrazu v optické mikroskopii