Informace o publikaci

Genome size in Cyperaceae

Název česky Velikost genomu u šáchorovitých
Autoři

BUREŠ Petr ZEDEK František ŠMARDA Petr ROTREKLOVÁ Olga HRALOVÁ Ivana

Druh Článek ve sborníku
Konference The Comparative Biology of the Monocotyledons
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Botanika
Klíčová slova base composition; Carex; chromosome size; Eleocharis; polyploidy
Popis V čeledi Cyperaceae je detekce polyploidie komplikovaná chromosomálními fúzemi a fragmentacemi (symploidie a agmatoploidie) v důsledku holokineticé povahy chromosomů. Studujíc karyotyp velikost genomu u Cyperaceae, jsme kombinovali molekulární metody, flow cytometrii a počítání chromosomů u Carex a Eleocharis. Tyto rody kontrastují počtem druhů, evolučními centry, ekologickou diversifikací, ale hlavně variabilitou velikostí genomu a chromosomů, která je u Eleocharis jedna z největších mezi rody krytosemenných rostlin (od 8.1 do 296 Mbp). Analyzovali jsme genomické parametry: velikost genomu, počet chromosomů, velikost chromosomů, AT/GC poměr, Ty3-gypsy a Ty1-copia retrotransposonovou diversitu a množství. Evoluční dynamika těchto druhopvě specifických parametrů mapovaná na fylogenetické vztahy, vycházející ze sekvenčních markerů (ITS, trnL-F) byla použita pro zhodnocení role polyploidie, agmatoploidie, symploidie, a retrotransposonové aktivity.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info