E-photosynthesis: Web-based platform for modeling of complex photosynthetic processes

Autoři ŠAFRÁNEK David ČERVENÝ Jan — KLEMENT Matej — POSPÍŠILOVÁ Jana — BRIM Luboš — LAZÁR Dušan — NEDBAL Ladislav
Druh Článek v odborném periodiku
Citace ŠAFRÁNEK, David, Jan ČERVENÝ, Matej KLEMENT, Jana POSPÍŠILOVÁ, Luboš BRIM, Dušan LAZÁR a Ladislav NEDBAL. E-photosynthesis: Web-based platform for modeling of complex photosynthetic processes. BioSystems, Elsevier, 2011, roč. 103, č. 2, s. 115-124. ISSN 0303-2647. doi:10.1016/j.biosystems.2010.10.013.
Originální jazyk angličtina
Obor Informatika
WWW http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S030326471000198X
Doi http://dx.doi.org/10.1016/j.biosystems.2010.10.013
Klíčová slova Biomodels repository; Computational models; Photosynthesis; Systems biology; Web platform

Článek představuje novou verzi webového portálu e-photosynthesis.org pro počítačové modelování procesů fotosyntézy. Oproti minulé verzi je kompletně přebudováno jádro i rozhraní systému. Systém je nyní připraven pro obecnou strukturu diferenciálních modelů kompatibilních s formátem SBML. Rozhraní umožňuje registrovaným uživatelem modifikaci parametrů a tvorbu vlastních simulačních profilů. Vlastní simulace modelů je realizována prostřednictvím ODE solveru Octave a je presentována uživateli prostřednictvím grafického zobrazení simulovaných křivek.

Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info