Project information
Evoluce holocentrických chromosomů
(EvoHolo)
- Project Identification
- GA13-29362S
- Project Period
- 1/2013 - 12/2016
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- prof. RNDr. Petr Bureš, Ph.D.
- Mgr. Lucie Horová
- Mgr. Ivana Lipnerová
- Mgr. Olga Rotreklová, Ph.D.
- Ing. Jakub Šmerda, Ph.D.
- Mgr. Adam Veleba, Ph.D.
- Mgr. František Zedek, Ph.D.
Adaptivní vznik holocentrických chromosomu (bez lokalizované centromery) jako obrany proti centromerickému tahu bude testován pomocí selekcních režimu pusobících na geny kinetochorových proteinu. K objasnení prekvapive negativní korelace 2C/2n a znacné divergence velikostí a poctu holocentrických chromosomu je navržen nový evolucní mechanismus "holokinetický tah", který bude testován analýzou segregace fragmentovaných/nefragmentovaných homologu v potomstvu strukturálních heterozygotu pripravených rentgenovým zárením. Velikost genomu a genomický obsah GC, proporce a efektivita jednotlivých mechanismu karyotypové evoluce (aneuploidie, polyploidie, fúze/fragmentace chromosomu, proliferace/odstranování repetitivní DNA) budou analyzovány v holocentrických (Cyperaceae+Juncaceae, Chionographideae, Cuscuta subg. Cuscuta a Grammica, Drosera) a jejich sesterských monocentrických liniích pomocí prutokové cytometrie, pocítání chromosomu a nove vyvinutého fylogentického algoritmu. Bude vyvinuta nová detekcní technika pro masívní skríning holocentrismu u rostlin kombinující zárení a cytometrii.
Publications
Total number of publications: 9
2017
-
Evolution of genome size and genomic GC content in carnivorous holokinetics (Droseraceae)
Annals of Botany, year: 2017, volume: 119, edition: 1, DOI
2016
-
Absence of positive selection on CenH3 in Luzula suggests that holokinetic chromosomes may suppress centromere drive
Annals of Botany, year: 2016, volume: 118, edition: 7, DOI
-
CenH3 evolution reflects meiotic symmetry as predicted by the centromere drive model
Scientific Reports, year: 2016, volume: 6, edition: September, DOI
-
Flow cytometry may allow microscope-independent detection of holocentric chromosomes in plants
Scientific Reports, year: 2016, volume: 6, edition: June, DOI
2014
-
Ecological and evolutionary significance of genomic GC content diversity in monocots
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, year: 2014, volume: 111, edition: 39, DOI
-
Genome size and genomic GC content evolution in the miniature genome-sized family Lentibulariaceae
New Phytologist, year: 2014, volume: 203, edition: 1, DOI
2013
-
Holokinetic Drive in the Karyotype Evolution of Monocots
Year: 2013, type: Conference abstract
-
Nutrient reserves may allow for genome size increase: evidence from comparison of geophytes and their sister non-geophytic relatives
Annals of Botany, year: 2013, volume: 112, edition: 6, DOI
-
The Evolution of Genome Size and Base Composition in Cyperid Clade
Year: 2013, type: