Project information
Evolution of genome size - a new role for the centromere drive
(Centrogenomtah)
- Project Identification
- GA20-15989S
- Project Period
- 1/2020 - 6/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Faculty of Science
Jelikož mechanika buněčného dělení vyžaduje zachování poměru mezi velikostí chromosomů a kinetochorů, měly by změny ve velikosti kinetochoru být reflektovány velikostními změnami chromosomů (a v konečném důsledku i genomů). Přestože je centromerický tah („drajv“) široce akceptován jako mechanismus evoluce kinetochorů u eukaryot s asymetrickou meiózou, dopad tohoto tahu na evoluci velikosti chromosomů a velikosti genomu nebyl nikdy studován. S využitím karyologie (u mitotických metafází) a průtokové cytometrie (v interfázních jádrech) v kombinaci s imunofluorecenčním barvením proto hodláme fylogeneticky analyzovat, jak tempo v evoluci velikosti chromosomů a genomů koreluje s tempem evoluce velikosti kinetochorů a intenzitou pozitivní selekce v evoluci CenH3 napříč eukaryoty: u „drajvujících“ živočichů a semenných rostlin oproti „nedrajvujícím“ houbám, mechorostům, plavuním a kapradinám i na jemné fylogenetické škále v modelových Brassicaceae a Poaceae s jejichž využitím budou validovány a optimalizovány klíčové analytické techniky.
Publications
Total number of publications: 13
2024
-
The global distribution of angiosperm genome size is shaped by climate
New Phytologist, year: 2024, volume: 242, edition: 2, DOI
2023
-
An insight into the functional genomics and species classification of Eudiplozoon nipponicum (Monogenea, Diplozoidae), a haematophagous parasite of the common carp Cyprinus carpio
BMC Genomics, year: 2023, volume: 24, edition: 1, DOI
-
Complex patterns of ploidy in a holocentric plant clade (Schoenus, Cyperaceae) in the Cape biodiversity hotspot
Annals of Botany, year: 2023, volume: 131, edition: 1, DOI
-
Evolution of genome size and GC content in the tribe Carduinae (Asteraceae): rare descending dysploidy and polyploidy, limited environmental control and strong phylogenetic signal
Preslia, year: 2023, volume: 95, edition: 1, DOI
-
Hybridization may endanger the rare North Apennine endemic Cirsium bertolonii
Plant Systematics and Evolution, year: 2023, volume: 309, edition: 3, DOI
2022
-
Application-based guidelines for best practices in plant flow cytometry
Cytometry: Part A, year: 2022, volume: 101, edition: 9, DOI
-
Holocentric plants are more competitive under higher UV-B doses
New Phytologist, year: 2022, volume: 233, edition: 1, DOI
-
Chromosome size matters: genome evolution in the cyperid clade
Annals of Botany, year: 2022, volume: 130, edition: 7, DOI
-
Kinetochore size scales with chromosome size in bimodal karyotypes of Agavoideae
Annals of Botany, year: 2022, volume: 130, edition: 1, DOI
-
Reference standards for flow cytometric estimation of absolute nuclear DNA content in plants
Cytometry: Part A, year: 2022, volume: 101, edition: 9, DOI