Project information
Molecular roles of micropeptides encoded by non-coding RNAs in cancer biology: a multi-omic analysis of the hidden translatome

Mikropeptidy kódované malými otevřenými čtecími rámci (sORF) v RNA, dosud klasifikovanými jako nekódující, představují nově objevenou třídu biologicky aktivních molekul s potenciálními regulačními funkcemi v nádorové biologii. Tento projekt si klade za cíl identifikovat a charakterizovat mikropeptidy odvozené z těchto RNA pomocí multiomického přístupu. Nejprve budou sORF identifikovány v transkriptech s dysregulovanou expresí v nádorových buňkách, přičemž analýza RNA-Seq dat bude doplněna o metody zkoumající jejich translační aktivitu. Následně budou vybrané mikropeptidy podrobeny funkční analýze s cílem objasnit jejich molekulární mechanismy působení, interakční partnery a zapojení do signálních drah. Získaná data přispějí k lepšímu porozumění skrytému translatomu a jeho roli v nádorových procesech. Glioblastomové buněčné linie budou v projektu využity jako model pro studium těchto mechanismů.