Project information
Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
- Project Identification
- NR8967
- Project Period
- 1/2006 - 12/2009
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Agriculture R&D Programme
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Medicine
- prof. MUDr. David Šmajs, Ph.D.
- Mgr. Petra Pospíšilová, Ph.D.
- prof. MUDr. Jan Šmarda, DrSc.
- Cooperating Organization
-
St. Anne's University Hospital Brno
- Responsible person doc. MUDr. Vladana Woznicová, Ph.D.
- Responsible person Mgr. Monika Dvořáková Heroldová, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Miroslav Votava, CSc.
- Responsible person MUDr. Jana Račovská
Projekt předpokládá vyšetření desítek až set kmenů a izolátů pddruhu T. pallidum ssp. apllidum v hypervariabilních oblastech genomu. Rozdíly v těchto sekvencích budou použity pro identifikaci individuálních kmenů tohoto poddruhu.
Rozdíly v genomech kmenů a izolátů poddruhu T. pallidum ssp. pallidum budou zjišťovány po PCR amplifikaci sekvenací PCR produktů. Bude navržen zjednodušený protokol na identifikaci nejčastějších kmenů na základě PCR aplifikace a RFLP.
Publications
Total number of publications: 90
2009
-
The complete genome sequence of T. paraluiscuniculi strain Cuniculi A and its comparison with syphilis spirochete genome.
Year: 2009, type: Conference abstract
-
Whole genome amplification and analysis: genome differences in the genus Treponema.
Year: 2009, type: Conference abstract
-
Whole genome sequencing of pathogenic and nonpathogenic treponemes: comparison of syphilis and yaws strains with T. paraluiscuniculi.
Clinical Microbiology and Infection, Volume 15, Issue s4, Abstracts of the 19th ECCMID, P1329, year: 2009
2008
-
A novel Treponema pallidum antigen, TP0136, is an outer membrane protein that binds human fibronectin.
INFECTION AND IMMUNITY, year: 2008, volume: 76, edition: 5
-
Celogenomové sekvenační metody: srovnání 3 metod při sekvenaci genomu Treponema pallidum subspecies pertenue Samoa D.
Year: 2008, type: Conference abstract
-
Complete genome sequence of Treponema pallidum ssp. pallidum strain SS14 determined with oligonucleotide arrays
BMC Microbiology, year: 2008, volume: 8, edition: 8
-
Diagnostika časné syfilidy metodou PCR, přínos pro klinickou praxi.
Year: 2008, type: Conference abstract
-
Genome differences in the genus Treponema.
XIX. Biologické dny, sborník abstrakt., year: 2008
-
Mapování sekvenčních rozdílů opičího izolátu Treponema pallidum Fribourg-Blanc a lidských patogenních spirochet.
Year: 2008, type: Conference abstract
-
PCR detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.
Year: 2008, type: Conference abstract