Hostitelský mikrobiom ve vztahu k rozvoji Barrettova jícnu a adenokarcinomu jícnu
- Project Identification
- NU20-03-00126
- Project Period
- 5/2020 - 12/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Health Research Programme 2020 - 2026
- Subprogram 1 - standard
- MU Faculty or unit
- Faculty of Medicine
- Other MU Faculty/Unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
University Hospital Olomouc
- Responsible person Doc. MUDr. Ondřej Urban, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Tomáš Haruštiak, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Robert Lischke, Ph.D.
- Responsible person Štěpán Hlava
- Responsible person doc. MUDr. Radek Kroupa, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Tomáš Grolich, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Lumír Kunovský, Ph.D.
- Responsible person Zdeněk Pavlovský
- Responsible person doc. MUDr. Jiří Dolina, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Vladimír Procházka, Ph.D.
- Responsible person prof. MUDr. Zdeněk Kala, CSc.
Hostitelský mikrobiom spolu s genetickou predispozicí jedince jsou důležitými faktory
v etiopatogenezi refluxní choroby jícnu (GERD), která významně zvyšuje riziko rozvoje ezofagitidy (RE), Barrettova jícnu (BE) a adenokarcinomu ezofagu (EAC). Cílem projektu je determinace markerů na úrovni mikrobiomu, genů hostitele a jejich interakcí pro časnější diagnostiku a predikci rozvoje BE a EAC.
Projekt obsahuje 3 části: (1) analýzu metagenomu a metatranskriptomu v několika lokalitách
gastrointestinálního traktu (GIT) u pacientů s GERD, (2) analýzu hostitelského exomu a transkriptomu ve tkáni jícnu u pacientů s BE/EAC, a (3) analýzu genetického profilu pacientů s GERD a jeho komplikacemi. Mutace v exomu/genomu pacienta a míra exprese genů ve tkáni jícnu budou korelovány s mikrobiomem a jeho funkční aktivitou v GITu a klinickým nálezem doplněným o in vivo endomikroskopii.
Na základě získaných dat se pokusíme navrhnout modifikaci standardního režimu péče o pacienty s GERD s cílem předejít pokročilým a ireverzibilním změnám snižujícím kvalitu života pacientů, resp. ohrožujících je na životě.
Publications
Total number of publications: 13
2022
-
Achalasia and acromegaly: co-incidence of these diseases or a new syndrome?
Biomedical Papers, year: 2022, volume: 166, edition: 2, DOI
2021
-
Autoimmune Diseases of Digestive Organs - A Multidisciplinary Challenge: A Focus on Hepatopancreatobiliary Manifestation
Journal of Clinical Medicine, year: 2021, volume: 10, edition: 24, DOI
-
Elevated epidermal growth factor receptor levels in Barrett’s esophagus
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Helicobacter pylori infection and other bacteria in pancreatic cancer and autoimmune pancreatitis
World Journal of Gastrointestinal Oncology, year: 2021, volume: 13, edition: 8, DOI
-
Increased TRPV1 gene expression in the tissues of Barrett's esophagus and esophageal adenocarcinoma
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Myofibroblastic tumor of the esophagus - a case report of long-term follow-up and literature review
Klinická onkologie, year: 2021, volume: 34, edition: 4, DOI
-
Myofibroblastický nádor jícnu
Year: 2021, type: Conference abstract
-
Orální mikrobiota a hojení sliznice dutiny ústní
Year: 2021, type: Conference abstract
2020
-
Biomarkery pro neendoskopické vyšetření sliznice jícnu
Vnitřní lékařství, year: 2020, volume: 66, edition: 7
-
Confocal laser endomicroscopy in the diagnostics of esophageal diseases: a pilot study
Vnitřní lékařství, year: 2020, volume: 66, edition: 5