Centroméry jsou nezbytné pro správnou segregaci monocentrických chromosomů. Vznik nových centromér na stejném chromosomu je označován jako repozice centromér (RC), respektive jako nové evoluční centroméry (NEC). Domníváme se, že vznik a zrání nových centromér může modifikovat epigenetickou krajinu, transkripci, rekombinaci na daném chromosomu, a může vést k reprodukční izolaci a speciaci. Tribus Arabideae z čeledi brukvovitých je skupinou s nejvyšším počtem dokumentovaných NEC u rostlin. Pokročilé sekvenování dlouhých čtení, společně s novými algoritmy sestavování genomových sekvencí umožňují telomere-to-telomere sekvenování, včetně čtení komplexních (peri)centromerických oblastí. Navrhujeme analyzovat NEC u Arabideae druhů s použitím sekvenování dlouhých čtení, doplněné o cytogenomické a epigenetické analýzy, s cílem zkoumat strukturu ENC a dopady RC na rekombinaci, transkripci, a reporodukční izolaci. Výsledky projektu poskytnou nové poznatky o životním cyklu komplexních centromér rostlin.

Sustainable Development Goals

Masaryk University is committed to the UN Sustainable Development Goals, which aim to improve the conditions and quality of life on our planet by 2030.