Project information
Polymorfní G-quadruplexy v promotorových oblastech genů
- Project Identification
- GA17-12075S
- Project Period
- 1/2017 - 12/2019
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
- Central European Institute of Technology
- Cooperating Organization
-
Institute of Biophysics
- Responsible person prof. RNDr. Michaela Vorlíčková, DrSc.
G-kvadruplexy (G4) jsou čtyř-řetězové DNA struktury. Sekvence, které mají schopnost
formovat G4 se hojně vyskytují v lidském genomu. G4 se ve zvýšené míře vyskytují v promotorových oblastech genů. G4 podílející se na regulaci transkripce jsou jednou z nejvíce
studovaných skupin strukturních motivů DNA. Stabilizace G4 motivů pomocí nízkomolekulárních
látek, jež vede k modulaci exprese onkogenů, se jeví jako velmi slibný přístup léčby rakoviny.
G4 motivy jsou strukturně polymorfní; G4 povětšinou existují jako směs různých a různě
populovaných konformačních stavů. Populace jednotvých stavů jsou určeny jejich
termodynamickou stabilitou a zaroveň i rychlostí jejich formování. Nicméně, ne všechny
vlastnosti vykazované polymorfními G4, včetně polymorfismu jako takvého, jsou nutně důležité
pro jejich biologickou funkci. Schopnost identifikovat funkčně důležité vlastnosti polymorfních G4
motivů je předpokladem pro racionální vývoj léčiv vykazujících specificitu vůči konkrétním G4 motivům v konkrétních oblastech genomu.
Publications
Total number of publications: 9
2023
-
Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system
Publisher: European Patent Office, state: Germany, patent's number: EP3645018B1, year: 2023
-
Nanodiamonds as artificial proteins for regulation of a cell signalling system
Publisher: United States Patent and Trademark Office, state: United States, patent's number: US11744855B2, year: 2023
2020
-
Role of folding kinetics of secondary structures in telomeric G-overhangs in the regulation of telomere maintenance inSaccharomyces cerevisiae
Journal of Biological Chemistry, year: 2020, volume: 295, edition: 27, DOI
2019
-
In Cell NMR Spectroscopy: Investigation of G-Quadruplex Structures Inside Living Xenopus laevis Oocytes
G-QUADRUPLEX NUCLEIC ACIDS: METHODS AND PROTOCOLS, year: 2019, volume: 2035, edition: 2019, DOI
-
Parallel G-triplexes and G-hairpins as potential transitory ensembles in the folding of parallel-stranded DNA G-Quadruplexes
Nucleic acids research, year: 2019, volume: 47, edition: 14, DOI
-
Systematic investigation of sequence requirements for DNA i-motif formation
Nucleic acids research, year: 2019, volume: 47, edition: 5, DOI
2018
-
Analysis of binding interfaces of the human scaffold protein AXIN1 by peptide microarrays
Journal of Biological Chemistry, year: 2018, volume: 293, edition: 42, DOI
-
Nanodiamonds as "artificial proteins": Regulation of a cell signalling system using low nanomolar solutions of inorganic nanocrystals
Biomaterials, year: 2018, volume: 176, edition: SEP 2018, DOI
2017
-
Structure-activity relationships in polymorphic G-quadruplex forming segment of c-MYC promoter
Year: 2017, type: Conference abstract