Project information
Ztráta specifických repetic DNA v důsledku dysfunkce CAF1 u rostlin
- Project Identification
- GAP501/11/0289
- Project Period
- 1/2011 - 12/2015
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
-
Central European Institute of Technology
- prof. RNDr. Jiří Fajkus, CSc.
- Mgr. Karin Jaške, Ph.D.
- Jana Kapustová
- Mgr. Petr Mokroš, Ph.D.
- Mgr. Iva Mozgová, Ph.D.
- Mgr. Veronika Pavlištová, Ph.D.
- Mgr. Petra Procházková Schrumpfová, Ph.D.
Chromatin assembly factor 1 (CAF1) je třísložkový histonový chaperon, který ukládá histony H3/H4 na replikující se DNA. Mutanti Arabidopsis v CAF1 vykazují abnormální morfologii, změny v umlčování genů a zvýšenou homologní rekombinaci. Naše pilotní studie ukázala, že dysfunkce CAFI má za následek zkracování telomer a značnou ztrátu 45S rDNA, aniž by byly ovlivněny ostatní DNA repetice v genomu Arabidopsis. Pomocí genetických a biochemických přístupů budeme testovat naši hypotézu, že pozorovaná ztráta telomer a 45S rDNA je způsobena neúplnou replikací (v důsledku zastavující se replikace v těchto lokusech) a následných opravných procesů. Bude rovněž zkoumána účast jiných mechanismů (např. nedostatečnost telomerázy, kolize transkripce a replikace). Příčinná role mutací v CAF1 bude testována zpětným křížením a komplementací s cílem indukovat možnou reverzi genomických změn. Cílem projektu je tedy objasnit vzájemný vliv genetických a epigenetických procesů (sestavování chromatinu, replikace, rekombinace a oprav DNA, udržování telomer) na stabilitu genomu.
Publications
Total number of publications: 8
2016
-
Phenotypic reversion in fas mutants of Arabidopsis thaliana by reintroduction of FAS genes: variable recovery of telomeres with major spatial rearrangements and transcriptional reprogramming of 45S rDNA genes
Plant Journal, year: 2016, volume: 88, edition: 3, DOI
2015
-
Homology-dependent repair is involved in 45S rDNA loss in plant CAF-1 mutants
Plant Journal, year: 2015, volume: 81, edition: 2, DOI
-
Chromatin dynamics of plant telomeres and ribosomal genes
The Plant Journal, year: 2015, volume: 83, edition: 1, DOI
2014
-
Epigenetic Regulation of Telomere Maintenance
Cytogenetic and Genome research, year: 2014, volume: 143, edition: 1-3, DOI
2013
-
A telomerase-independent component of telomere loss in chromatin assembly factor 1 mutants of Arabidopsis thaliana
Chromosoma, year: 2013, volume: 122, edition: 4, DOI
-
Subnuclear partitioning of rRNA genes between the nucleolus and nucleoplasm reflects alternative epiallelic states
GENES & DEVELOPMENT, year: 2013, volume: 27, edition: 14, DOI
2011
-
Epigenetic maintenance of plant telomeres
Year: 2011, type: Conference abstract
-
Hypomethylating drugs efficiently decrease cytosine methylationin telomeric DNA and activate telomerase without affectingtelomere lengths in tobacco cells
Plant Molecular Biology, year: 2011, volume: 77, edition: 4-5, DOI