Project information
Evoluce genomu alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) rozdílného fylogenetického stáří
- Project Identification
- GAP501/10/1014
- Project Period
- 1/2010 - 12/2012
- Investor / Pogramme / Project type
-
Czech Science Foundation
- Standard Projects
- MU Faculty or unit
-
Central European Institute of Technology
- prof. Mgr. Martin Lysák, Ph.D., DSc.
- Mgr. Martina Dvořáčková, Ph.D.
- RNDr. Terezie Malík Mandáková, Ph.D.
- Ing. Kateřina Toufarová
- Cooperating Organization
-
Charles University
- Responsible person prof. RNDr. Karol Marhold, CSc.
- Responsible person prof. Klaus Mummenhoff, Ph.D.
- Responsible person Walter Bleeker
- Responsible person Ulrike Coja
Polyploidie hraje významnou roli při speciaci semenných rostlin. Nicméně překvapivě málo je známo o stabilitě chromosomů v prvních generacích po vzniku alopolyploidů a u evolučně mladých polyploidů. Poprvé bude použita technika kombinované GISH a SMC (genomická in situ hybridizace a srovnávací malování chromosomů) u hybridních a alopolyploidních řeřišnic (Cardamine) k analýze intergenomických chromosomových interakcí. GISH identifikuje rodičovské chromosomové sady a intergenomické translokace, zatímco SMC odhalí inter- a intrachromosomové přestavby. Stabilita chromosomů bude analyzována u nedávno (ca. 100 let) vzniklého triploidního hybrida C.x insueta (2n=24) a autoalohexaploida C. schulzii (2n=48), evolučně staršího druhu C. flexuosa (2n=32), a jejich domnělých rodičovských druhů. U tří analyzovaných alopolyploidních taxonů budou etablovány syntetické linie a chromosomová stabilita monitorována v posloupných generacích. Projekt ozřejmí spojitost mezi chromosomovými přestavbami a evolucí alopolyploidních genomů rostlin.
Publications
Total number of publications: 7
2017
-
Young inversion with multiple linked QTLs under selection in a hybrid zone
Nature Ecology and Evolution, year: 2017, volume: 1, edition: 5, DOI
2016
-
How diploidization turned a tetraploid into a pseudotriploid
American Journal of Botany, year: 2016, volume: 103, edition: 7, DOI
2014
-
Cardamine hirsuta: a versatile genetic system for comparative studies
The Plant Journal, year: 2014, volume: 78, edition: 1, DOI
-
Multiple hybridization events in Cardamine (Brassicaceae) during the last 150 years: revisiting a textbook example of neoallopolyploidy
Annals of Botany, year: 2014, volume: 113, edition: 5, DOI
-
The widespread crucifer species Cardamine flexuosa is an allotetraploid with a conserved subgenomic structure
New Phytologist, year: 2014, volume: 201, edition: 3, DOI
2013
-
Analysis of Plant Meiotic Chromosomes by Chromosome Painting
Plant Meiosis: Methods and Protocols, year: 2013, number of pages: 12 s.
-
The More the Merrier: Recent Hybridization and Polyploidy in Cardamine
Plant Cell, year: 2013, volume: 25, edition: 9, DOI