Project information
Proteotypová klasifikace renálního karcinomu ve vztahu k prognóze a terapeutické odpovědi
- Project Identification
- NV19-08-00250
- Project Period
- 5/2019 - 12/2023
- Investor / Pogramme / Project type
-
Ministry of Health of the CR
- Ministry of Health Research Programme 2015 - 2022
- MU Faculty or unit
-
Faculty of Science
- doc. Mgr. Pavel Bouchal, Ph.D.
- Mgr. Pavla Bouchalová, Ph.D.
- Mgr. Lucia Janáčová
- Mgr. Petr Lapčík, Ph.D.
- Cooperating Organization
-
University Hospital Pilsen
- Responsible person prof. MUDr. Milan Hora, Ph.D., MBA
- Responsible person MUDr. Ondřej Fiala, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Alexandr Poprach, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Alice Hlobilková, Ph.D.
- Responsible person doc. MUDr. Radek Lakomý, Ph.D.
- Responsible person MUDr. Ján Podhorec
Renální karcinom (RCC) přestavuje závažné onkologické onemocnění s celosvětově nejvyšší incidencí v České republice, přičemž spolehlivé molekulární prognostické a prediktivní biomarkery nejsou dosud k dispozici. Pro jejich “high-throughput“ vyhledávání a validaci zavedeme novou metodiku digitálního biobankingu založenou na získávání proteinových fingerprintů (proteotypů) pomocí hmotnostní spektrometrie v tzv. “data independent acquisition” módu. S využitím nově zavedené techniky budou analyzovány dva velmi dobře charakterizované soubory nádorů, získaná data budou statisticky hodnocena s cílem nalézt: (i) proteinové biomarkery identifikující pacienty s lokalizovaným RCC avšak s vyšším rizikem, kteří by měli být detailněji sledováni, a (ii) proteinové biomarkery související se špatnou odpovědí metastatických nádorů ledvin na léčbu tyrosinkinasovými inhibitory v první linii. Očekáváme, že nalezené patterny, potenciální biomarkery, resp. potenciální terapeutické cíle pomohou přispět k zefektivnění terapie pacientů s nádory ledvin.
Publications
Total number of publications: 27
2020
-
Rola katechol-O-metyltransferázy u estrogén-receptor pozitívnych nádorov prsníka
Year: 2020, type: Conference abstract
-
SWATH-MS Analysis of FFPE Tissues Identifies Stathmin as a Potential Marker of Endometrial Cancer in Patients Exposed to Tamoxifen
Journal of Proteome Research, year: 2020, volume: 19, edition: 7, DOI
-
Transgelin contributes to a poor response of metastatic renal cell carcinoma to sunitinib treatment
Year: 2020, type: Conference abstract
-
Transgelin negativně přispívá k léčebné odpovědi pacientů s metastatickým reálním karcinomem léčených tyrosinkinasovými inhibitory
Year: 2020, type: Conference abstract
-
Transgelin Silencing Induces Different Processes in Different Breast Cancer Cell Lines
Proteomics, year: 2020, volume: 20, edition: 7, DOI
2019
-
DDA, DIA, či directDIA: závisle, s knihovnou či bez? Praktické porovnání přístupů pro různé typy proteomických experimentů
Year: 2019, type: Appeared in Conference without Proceedings
-
SWATH-MS identifikácia calcyphosinu a stathminu-1 ako markerov agresivity nádorov endometria s odlišnou špecifitou
Year: 2019, type: Conference abstract