Mgr. Monika Čechová, Ph.D.

2022

• HiC-TE: a computational pipeline for Hi-C data analysis to study the role of repeat family interactions in the genome 3D organization

  LEXA Matej ČECHOVÁ Monika NGUYEN Son Hoang JEDLIČKA Pavel TOKAN Viktor KUBÁT Zdeněk HOBZA Roman KEJNOVSKÝ Eduard

  Recenzovaný odborný článek

  BIOINFORMATICS, rok: 2022, ročník: 38, vydání: 16, DOI

• Satellite DNAs and human sex chromosome variation

  ČECHOVÁ Monika MIGA Karen H

  Recenzovaný odborný článek

  SEMINARS IN CELL & DEVELOPMENTAL BIOLOGY, rok: 2022, ročník: 128, vydání: 128, DOI

2020

• Dynamic evolution of great ape Y chromosomes

  ČECHOVÁ Monika VEGESNA Rahulsimham TOMASZKIEWICZ Marta HARRIS Robert S CHEN Di RANGAVITTAL Samarth MEDVEDEV Paul MAKOVA Kateryna D

  Recenzovaný odborný článek

  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, rok: 2020, ročník: 117, vydání: 42, DOI

• Probably Correct: Rescuing Repeats with Short and Long Reads

  ČECHOVÁ Monika

  Recenzovaný odborný článek

  genes, rok: 2020

• Ten simple rules for biologists initiating a collaboration with computer scientists

  ČECHOVÁ Monika

  Recenzovaný odborný článek

  Plos Computational Biology, rok: 2020

2019

• High Satellite Repeat Turnover in Great Apes Studied with Short- and Long-Read Technologies

  ČECHOVÁ Monika HARRIS Robert S TOMASZKIEWICZ Marta ARBEITHUBER Barbara CHIAROMONTE Francesca MAKOVA Kateryna D

  Recenzovaný odborný článek

  Molecular Biology and Evolution, rok: 2019, ročník: 36, vydání: 11, DOI

2016

• A time- and cost-effective strategy to sequence mammalian Y Chromosomes: an application to the de novo assembly of gorilla Y

  TOMASKIEWICZ Marta RANGAVITTAL Samarth ČECHOVÁ Monika

  Recenzovaný odborný článek

  Genome Research, rok: 2016

2015

• Fully automated pipeline for detection of sex linked genes using RNA-Seq data

  MICHALOVOVÁ Monika KUBAT Z HOBZA Roman VYSKOT Boris KEJNOVSKÝ Eduard

  Recenzovaný odborný článek

  BMC Bioinformatics, rok: 2015, ročník: 16, DOI

2013

• Analysis of plastid and mitochondrial DNA insertions in the nucleus (NUPTs and NUMTs) of six plant species: size, relative age and chromosomal localization

  MICHALOVOVÁ Monika VYSKOT Boris KEJNOVSKÝ Eduard

  Recenzovaný odborný článek

  Heredity, rok: 2013, ročník: 111, vydání: 4, DOI

• Expansion of Microsatellites on Evolutionary Young Y Chromosome

  KEJNOVSKÝ Eduard MICHALOVOVÁ Monika ŠTEFLOVÁ Pavlína KEJNOVSKÁ Iva MANZANO Susana HOBZA Roman KUBÁT Zdeněk KOVAŘÍK Jan JAMILENA Manuel VYSKOT Boris

  Recenzovaný odborný článek

  PLoS One, rok: 2013, ročník: 8, vydání: 1, DOI