Ribosome hibernation in archaea

• Název česky: Hibernace ribozomů u archaei
• Autoři: HASSAN Ahmed Adel I. H.; ITO Kosuke; UCHIUMI Toshio; DEMO Gabriel
• Rok publikování: 2023
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Středoevropský technologický institut

Přiložené soubory

• 2023_CSBMB_Demo_final.pdf

• Popis: Za stresových podmínek v bakteriálních buňkách je tvorba hibernujícího ribozomového dimeru (označovaného jako 100S) užitečným adaptačním mechanismem, jehož výsledkem je potlačení syntézy proteinů ve stacionární fázi. U E. coli se na regulaci dimerizace ribozomu 70S podílejí dva proteinové faktory, RMF a HPF. RMF se přímo podílí na dimerizaci 70S ribozomů a HPF stabilizuje 100S ribozomy. Nicméně homologní proteiny RMF a HPF nebyly nalezeny v archaei. Proto jsou zapotřebí výzkum molekulárních mechanismů hibernace ribozomů u archaei. Zde uvádíme studii kryo-EM, která odhaluje nový faktor dimerizace ribozomů (RDF) v archei. RDF je vysoce specifický pro archeální ribozomy a je schopen interagovat pouze s archeální 30S malou ribozomální podjednotkou. Aby bylo možné určit strukturu nového RDF, byly použity nové přístupy k budování de novo modelu v kombinaci s umělou inteligencí (AI). Celková architektura dimeru 30S-30S ukazuje orientaci hlavy na tělo. RDF spojuje oblasti hlavy a těla dvou odlišných molekul 30S ve formě dimeru. Vazebná poloha RDF monomerní struktury na hlavě podjednotky 30S implikuje mechanickou roli při regulaci vazby mRNA na podjednotku 30S. Na druhé straně podjednotky 30S nejsou schopny zahájit translaci a zůstavaji v režimu hibernace.

Související projekty

• Národní institut virologie a bakteriologie