Informace o publikaci
Makrorestrikční analýza genomu a výskyt profágů u exfoliatin-pozitivních kmenů Stahylococcus aureus
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2001 |
| Druh | Článek ve sborníku |
| Konference | V. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Obor | Genetika a molekulární biologie |
| Klíčová slova | Staphylococcus aureus; exfoliative toxins; macrorestriction analysis; ribotyping; PCR ribotyping |
| Popis | Staphylococcus aureus tvoří exfoliatiny (ETs), které u lidí vyvolávají toxickou epidermolýzu. Ta se projevuje v mírnější formě výsevem kožních puchýřů a v generalizované formě způsobuje tzv. syndrom opařené kůže (SSSS). Genomové DNA 17 exfoliatin-pozitivních kmenů S. aureus izolovaných z pacientů a bacilonosičů byly analyzovány pulzní gelovou elektroforézou (PFGE). Na základě analýzy polymorfismu délky SmaI restrikčních fragmentů byly kmeny rozděleny do pěti PFGE typů: ET1(6 kmenů) ET2 (5 kmenů), ET3 (3 kmeny), ET4 (2 kmeny) a ET5 (1 kmen). Do PFGE typů ET1 a ET4 byly zařazeny izoláty původem z lokality I a do typů ET2, ET3 a ET5 izoláty pocházející z lokality II. Šest kmenů náležejících převládajícímu PFGE typu ET1 měly následující fenotyp: exfoliatin A-pozitivní (ETA+); hemolyzin alfa; citlivost k oxacilinu a fagotyp 71. Jeden kmen z lokality I tvořil vedle ETA enterotoxin C. Z devíti kmenů z lokality II jeden produkoval současně ETA a TSST-1 toxin. Pomocí PCR byly identifikovány geny pro ETA a pro ETB vznikem amplifikačních produktů 119 bp a 200 bp. U tří kmenů, které tvořily ETB současně s exfoliatinem A, byla prokázána lokalizace etb genu na plazmidu. Hybridizací s molekulárními sondami, připravenými ze specifických sekvencí fágů f53 a f77 byla provedena analýza přítomnosti profágů sérologických skupin B a F v genomu ET-pozitivních kmenů S. aureus. Při hybridizaci HindIII a EcoRI spekter se sondou fága 77 byl zjištěn pozitivní signál u dvou kmenů, které náležely PFGE typu ET4 a vykazovaly silnou produkci ETA, jež mohla být výsledkem lyzogenní konverze. Sonda fága 53 hybridizovala s restrikčními fragmenty 94 % kmenů a poskytla různé hybridizační profily signálů v HindIII a EcoRI spektrech. Bylo zjištěno, že s hybridizačními profily obou restrikčních spekter nejvíce koreloval PFGE typ ET3. Závěrem lze konstatovat, že kmeny pocházející ze dvou geograficky vzdálených lokalit byly navzájem geneticky odlišné, přestože měly podobné fenotypové vlastnosti. |
| Související projekty: |