Informace o publikaci
Genomová amplifikace a restrikční mapování patogenních spirochet rodu Treponema.
| Autoři | |
|---|---|
| Rok publikování | 2005 |
| Druh | Konferenční abstrakty |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Cíl: Stanovit rozdíly mezi genomy čtyř příbuzných treponemálních kmenů zahrnující T. pallidum subsp. pallidum Nichols, T. pallidum subsp. pallidum SS14, T. pallidum subsp. pertenue Samoan D a T. paraluiscuniculi metodou DNA fingerprintingu. Materiál a metody: Genomy studovaných kmenů byly rozděleny do 94 vzájemně se překrývajících oblastí. Každá z těchto oblastí byla pomocí XL PCR amplifikována a získané PCR produkty byly štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Byla zjištěna vysoká míra sekvenční homologie mezi vyšetřenými kmeny. Ukazuje to na možnost, že rozdílná virulence treponemálních kmenů je podmíněna relativně malými odlišnostmi v příslušných genomech. Tyto odlišnosti jsou soustředěny zejména ve skupině genů tpr, 12-ti genech specifických pro T. pallidum o zatím neznámé funkci. Identifikovaných nukleotidových záměn lze využít při molekulární identifikaci treponemálních kmenů. |
| Související projekty: |