RNA kink-turns as molecular elbows: Hydration, cation binding, and large-scale dynamics

• Název česky: RNA kink-turn jako molekulové lokty: Hydratace, vazba iontů a dynamika
• Autoři: RÁZGA Filip; ZACHARIAS Martin; RÉBLOVÁ Kamila; KOČA Jaroslav; ŠPONER Jiří
• Rok publikování: 2006
• Druh: Článek v odborném periodiku
• Časopis / Zdroj: Structure
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Fyzikální chemie a teoretická chemie
• Klíčová slova: Kink-turn; A-minor motif; RNA flexibility; Molecular Dynamics; Ribosome function
• Popis: K-turn motivy jsou funkční klíčové RNA elementy (např:A-site finger and L7/L12 stalk), které regulují flexibilitu ribosomální RNA během procesu translokace. Explicit solvent MD simulace ukazují, že tyto struktury jsou asociovány se sití molekul vod, které významně ovlivňují jejich konformace.

Související projekty

• Proteiny v metabolismu a při interakci organismů s prostředím
• Strukturní biofyzika makromolekul