PCR detekce a kmenová typizace spirochety Treponema pallidum v biologickém materiálu.

• Autoři: FLASAROVÁ Magdalena; ŠMAJS David
• Rok publikování: 2008
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Popis: Cílem práce bylo izolovat a detegovat DNA původce syfilis Treponema pallidum poddruhu pallidum z různých typů klinického materiálu od pacientů v různých stádiích syfilis a jednotlivé získané izoláty následně typizovat. Celkem bylo vyšetřeno 333 klinických vzorků od 213 pacientů, z toho 144 sér od 117 pacientů, 72 stěrů od 58 pacientů, 67 sraženin od 61 pacientů, 44 vzorků plné krve od 41 pacientů, 2 tkáně od 2 pacientů, 2 likvory od 2 pacientů a 2 punktáty od 2 pacientů. Celkem bylo vyšetřeno 5 vzorků od 3 novorozenců s kongenotální syfilis. U všech klinických izolátů byla provedena detekce treponemální DNA pomocí dvoukrokové (nested) PCR na gen tmpC (TP0316;kódující membránový lipoprotein) a na gen polA (TP0105;kódující DNA polymerázu 1). Pro typizaci PCR pozitivních klinických vzorků byly amplifikovány části genů TP0136, TP0548, a to primery unikátními pro T. pallidum a vzniklé PCR produkty byly sekvenovány dideoxyterminátorovou metodou.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů
• Komparativní genomové sekvencování patogenních treponem a transkriptomová analýza T. pallidum ssp. pallidum