Proteome study on bacterium Paracoccus denitrificans and construction of 2-DE protein database

• Název česky: Proteomová analýza bakterie Paracoccus denitrificans a konstrukce 2-DE databáze bílkovin
• Autoři: BOUCHAL Pavel; PŘECECHTĚLOVÁ Petra; ZDRÁHAL Zbyněk; KUČERA Igor
• Rok publikování: 2004
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: VIII. Pracovní setkání biochemiků a molekulárních biologů. Sborník příspěvků.
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Biochemie
• Klíčová slova: Paracoccus denitrificans; Proteome; Database
• Popis: Celobuněčné lyzáty a membránové frakce bakterie Paracoccus denitrificans byly analyzovány pomocí dvourozměrné elektroforézy s imobilizovanými pH gradienty s cílem charakterizovat rozdíly v expresi proteinů během růstu za aerobních a několika typech anaerobních podmínek (s dusičnanem, dusitanem a oxidem dusným) a dále během růstu v přítomnosti respiračního inhibitoru azidu. Komparativní obrazová analýza 2-D gelů odhalila několik skupin z celkového počtu 800 proteinových skvrn, které byly charakteristicky indukovány anebo potlačeny v odpovědi na daný terminální akceptor elektronů. Také respirační inhibitor azid vykazoval významné ovlivnění proteinových profilů. Omezená informace o genomu studované bakterie neumožnila identifikovat více než 8 fyziologicky významných proteinů. V současné době se připravuje veřejné zpřístupění 2-DE databáze P.denitrificans.

Související projekty

• Mechanizmy regulace respiračních systémů denitrifikačních bakterií faktory prostředí
• Strukturně-funkční vztahy biomolekul a jejich role v metabolismu
• Genomy a jejich funkce