RNDr. David Sehnal, Ph.D.

2026

• MolViewStories: Interactive molecular storytelling

  SLANINÁKOVÁ Terézia CHARLOP-POWERS Zachary DOSHCHENKO Viktoriia ROSE Alexander S. MIDLIK Adam SEKULA Anna FONSECA Neli MORRIS Kyle L. BURLEY Stephen K. VELANKAR Sameer FLEMING Jennifer VALLAT Brinda AUTIN Ludovic SEHNAL David

  Recenzovaný odborný článek

  PROTEIN SCIENCE, rok: 2026, ročník: 35, vydání: 4, DOI

• PDBe: enhanced structural data exploration to facilitate discovery

  AFONSO Marcelo Querino Lima PIDRUCHNA Ivanna NAIR Sreenath MIDLIK Adam LAWAL Dare VOLLMAR Melanie APPASAMY Sri Devan CHOUDHARY Preeti KUNNAKKATTU Ibrahim Roshan BERTONI Damian ESCOBAR Cristian A. BALASUBRAMANIYAN Balakumaran GÁBOROVÁ Romana LEINES Grisell Diaz HARRUS Deborah GUPTA Deepti EVANS Genevieve L. PARAMVAL Urmila MAGANA Paulyna TANWEER Ahsan TODOR Mihai THORPE Christopher J. TSENKOV Maxim GANGULY Sudakshina ELLAWAY Joseph BUENO Weslley Morellato BELLAICHE Adam SEHNAL David SVOBODOVÁ Radka FLEMING Jennifer R. VELANKAR Sameer

  Recenzovaný odborný článek

  NUCLEIC ACIDS RESEARCH, rok: 2026, ročník: 54, vydání: D1, DOI

2025

• MolViewSpec: a Mol* extension for describing and sharing molecular visualizations

  MIDLIK Adam BITTRICH Sebastian FLEMING Jennifer R NAIR Sreenath VELANKAR Sameer BURLEY Stephen K YOUNG Jasmine Y VALLAT Brinda SEHNAL David

  Recenzovaný odborný článek

  Nucleic Acids Research, rok: 2025, ročník: 53, vydání: W1, DOI

• Refining Structure-Based Search in AlphaFold DB: Including confidence metrics into AlphaFind

  SLANINÁKOVÁ Terézia MARŠÁLKOVÁ Eva GREŠOVÁ Katarína KŘENEK Aleš OĽHA Jaroslav PAVLÍK Tomáš ŠPRINGEROVÁ Pavlína SEHNAL David ANTOL Matej

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2025, druh: Konferenční abstrakty, DOI

• Visualizing and analyzing 3D biomolecular structures using Mol* at RCSB.org: Influenza A H5N1 virus proteome case study

  BITTRICH Sebastian ROSE Alexander S SEHNAL David DUARTE Jose M ROSE Yana SEGURA Joan PIEHL Dennis W VALLAT Brinda SHAO Chenghua BHIKADIYA Charmi LIANG Jesse MA Mark GOODSELL David S BURLEY Stephen K DUTTA Shuchismita

  Recenzovaný odborný článek

  Protein Science, rok: 2025, ročník: 34, vydání: 4, DOI

2024

• Analysis and Visualization of Protein Channels, Tunnels, and Pores with MOLEonline and ChannelsDB 2.0

  ŠPAČKOVÁ Anna BAZGIER Václav RAČEK Tomáš SEHNAL David SVOBODOVÁ Radka BERKA Karel

  Kapitola v odborné knize

  Protein Bioinformatics, vydání: Vyd. 1, rok: 2024, počet stran: 15 s., DOI

• Describing and Sharing Molecular Visualizations Using the MolViewSpec Toolkit

  BITTRICH Sebastian MIDLIK Adam VARADI Mihaly VELANKAR Sameer BURLEY Stephen K YOUNG Jasmine Y SEHNAL David VALLAT Brinda

  Recenzovaný odborný článek

  Current Protocols, rok: 2024, ročník: 4, vydání: 7, DOI

• ChannelsDB 2.0: a comprehensive database of protein tunnels and pores in AlphaFold era

  ŠPAČKOVÁ Anna VÁVRA Ondřej RAČEK Tomáš BAZGIER Václav SEHNAL David DAMBORSKÝ Jiří SVOBODOVÁ Radka BEDNÁŘ David BERKA Karel

  Recenzovaný odborný článek

  Nucleic Acids Research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: D1, DOI

• Mesoscale explorer: Visual exploration of large-scale molecular models

  ROSE Alexander SEHNAL David GOODSELL David S AUTIN Ludovic

  Recenzovaný odborný článek

  Protein Science, rok: 2024, ročník: 33, vydání: 10, DOI

• Visualizing Volumetric and Segmentation Data using Mol* Volumes & Segmentations 2.0

  CHARESHNEU Aliaksei CANTARA Alessio TICHY Dominik SEHNAL David

  Recenzovaný odborný článek

  Current Protocols, rok: 2024, ročník: 4, vydání: 12, DOI