Comparing genomes of pathogenic and non-pathogenic spirochetes: DNA-microarray hybridizations, whole genome fingerprinting and DNA sequencing.

• Název česky: Srovnání genomů patogenních a nepatogenních spirochet pomocí DNA-microarray hybridizace, whole genome fingerprintingu a DNA sekvenování.
• Autoři: ŠMAJS David; MATĚJKOVÁ Petra; STROUHAL Michal; NORRIS S.J.; WEINSTOCK G.M.
• Rok publikování: 2005
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Popis: Genomy blízce příbuzných treponem, Treponema pallidum ssp. pallidum (kmenů Nichols a SS14) a Treponema pallidum ssp. pertenue (Samoan D) byly porovnány s genomem Treponema paraluiscuniculi (kmenCuniculi A) s použitím technik komparativní genomiky. Ve srovnání s kmenem Nichols jsme nalezli, 1, 8 a 34 změn pro cílovou sekvenci restriktázy BamH I a 3, 7 a 20 inzercí a delecí v genomech SS14, Samoan D a T. paraluiscuniculi.

Související projekty

• Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
• Komparativní genomika patogenních spirochet rodu Treponema: cesta k sekvenčně specifické diagnostice
• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací