Restrikční mapování blízce příbuzných spirochet rodu Treponema.

• Autoři: STROUHAL Michal; ŠMAJS David
• Rok publikování: 2006
• Druh: Konferenční abstrakty
• Fakulta / Pracoviště MU: Lékařská fakulta
• Popis: Cíl: Stanovit rozdíly mezi genomy čtyř blízce příbuzných spirochet rodu Treponema metodou DNA fingerprintingu. Materiál a metody: Byly vyšetřeny kmeny Nichols, SS14 (T. p. pallidum), Samoan D (T. p. pertenue) a Cuniculi A (T. paraluiscuniculi). Na základě kompletní nukleotidové sekvence kmene Nichols byly genomy vybraných zástupců rozděleny do 97 překrývajících se intervalů; intervaly byly amplifikovány a štěpeny restrikčními enzymy BamH I, EcoR I a Hind III. Restrikční profily jednotlivých kmenů byly srovnány a použity k identifikaci heterologních oblastí. Rozdíly v genomech byly soustředěny zejména do skupiny tpr genů a do skupiny hypotetických genů, které se nacházejí v jejich blízkosti. Ukazuje to na možnost, že rozdílná virulence treponemálních kmenů je podmíněna relativně malými odlišnostmi v příslušných genomech. Identifikovaných nukleotidových záměn lze využít při molekulární identifikaci treponemálních kmenů a izolátů.

Související projekty

• Postgenomické studie syfilitické spirochety Treponema pallidum
• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Molekulární typizace kmenů a izolátů Treponema pallidum subsp. Pallidum: základ pro epidemiologickou a klinickou identifikaci jednotlivých kmenů