Využití metody ARDRA pro druhovou identifikaci nových kmenů bakterií rodu Bifidobacterium

• Autoři: KŠICOVÁ Kateřina; ŠPANOVÁ Alena; RITTICH Bohuslav
• Rok publikování: 2007
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: XI. Setkání biochemiků a molekulárních biologů
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Klíčová slova: Bifidobacterium; ARDRA; identification
• Popis: Pomocí ARDRA analýzy identifikovat bakteriální kmeny isolované z humánních zdrojů, které byly rodově specifickou PCR zařazeny do rodu Bifidobacterium a které při použití druhově specifických PCR vykazovaly zkřížené reakce a proto nemohly být zařazeny do druhů. Restrikční analýza amplikonu 914bp pomocí restriktáz AluI a Sau3 AI umožnila odlišení druhů B .adolescentis, B. bifidum, B. breve, B. catenulatum, B. infantis a B. longum. Celkem bylo rozlišeno a zařazeno do druhů deset z jedenácti nově isolovaných kmenů. Lze konstatovat, že ARDRA analýza je rychlá a reprodukovatelná identifikační metoda s vysokým diskriminačním potenciálem na úrovni druhu.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů bakterií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin