Molecular characteristics of Bifidobacterium strains collected in the Czech Collection of Microorganisms (CCM) and Laktoflora(CCDM) and reclassification of Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 as Bifidobacterium pseudocatenulatum

• Název česky: Molekulární charakterizace kmenů Bifidobacterium uložených ve České sbírce mikroorganismů (CCM) a Laktoflora (CCDM) a reklasifikace Bifidobacterium adolescentis CCM 3761 na Bifidobacterium pseudocatenulatum
• Autoři: RITTICH Bohuslav; ŠPANOVÁ Alena; BURDYCHOVÁ Radka; KŘÍŽOVÁ Jana; DRÁB Vladimír; DRBOHLAV Jan
• Rok publikování: 2007
• Druh: Článek ve sborníku
• Konference: 2nd Symposium on Propionibacteria and Bifidobacteria
• Fakulta / Pracoviště MU: Přírodovědecká fakulta
• Obor: Genetika a molekulární biologie
• Klíčová slova: Bifidobacterium; identification; PCR; ARDRA; rep-PCR
• Popis: Šestnáct kmenů jedenácti druhů bakterií Bifidobacterium bylo použito k ověření testovaných metod. Kmeny byly získány České sbírky mikroorganismů (CCM, Brno) a Laktoflora (CCDM, Tábor). DNA byla amplifikována pomocí dvou rozdílných rodově specifických primerů z oblasti 16S rDNA. Pro restrikční analýzu byly použity amplikony dlouhé 914 a 523 bp. Byly pouzity restriktasy BamHI, Sau3AI, TaqI, Sau96I, AluI a NciI. Pro RAPD a rep-PCR bylo použito sedm náhodných primerů, případně primery BOXA1R a (GTG)5. bylo zjištěno, že zařazení kmene B. adolescentis CCM 3761 neodpovídá jeho taxonomické pozici a kmen byl reklasifikován jako B. pseudocatenulatum. Pro potvrzení identifikace kmenů byly sekvenovány amplikony oblasti 16S rDNA u kmenů B. adolescentis CCM 3761, B. catenulatum DSM 16992T, B. pseudocatenulatum CCM 7094T a B. adolescentis CCM 4987T.

Související projekty

• Molekulární podstata buněčných a tkáňových regulací
• Využití postupů na bázi molekulární genetiky při získávání nových kmenů bakterií s probiotickými vlastnostmi s cílem rozšíření specifických genetických zdrojů pro výrobu funkčních potravin