Informace o publikaci

Structural Dynamics of the Box C/D RNA Kink-Turn and Its Complex with Proteins: The Role of the A-Minor 0 Interaction, Long-Residency Water Bridges, and Structural Ion-Binding Sites Revealed by Molecular Simulations

Název česky Dynamika Loop E/Helix IV rRNA - L25 protein complexu
Autoři

ŠPAČKOVÁ Naděžda RÉBLOVÁ Kamila SPONER Jiri

Rok publikování 2010
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Jouranl of Physical Chemistry B
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
Obor Biofyzika
Klíčová slova RNA-protein complex; molecular dynamics; kink-turn; A-minor interaction
Popis The study is focused on investigation of Box C/D RNA Kink-Turn with two proteins: native archaeal L7ae protein and human 15.5 kDa protein. The simulations reveal structural details of the studied molecules on nanosecond time scale, i.e. structural dynamics of essential tertiary interaction within kink-turn, reduced kink-turn flexibility upon protein binding, structurally important water molecules and ion binding sites.
Související projekty:

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info