RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D.

2026

• SAMJ: fast image annotation on ImageJ/Fiji via segment anything model

  GARCÍA-LÓPEZ-DE-HARO Carlos FUSTER-BARCELÓ Caterina RUEDEN Curtis T. HERAS Jónathan ULMAN Vladimír FRANCO-BARRANCO Daniel INÉS Adrián ELICEIRI Kevin W. OLIVO-MARIN Jean-Christophe TINEVEZ Jean-Yves SAGE Daniel MUNOZ-BARRUTIA Arrate

  Recenzovaný odborný článek

  Nature Communications, rok: 2026, ročník: 17, vydání: 1, DOI

2025

• 2024 OME-NGFF Workflows Hackathon

  LÜTHI Joel ALBERT Marvin ANITA Liviu BABALOLA Kola BENNETT Davis BOGOVIC John CERRONE Lorenzo DORNIER Rémy EGLINGER Jan GALINOVA Vera GERBER Reto GROS Oane HAHMANN Stefan HESS Max HORNBACHNER Ruth HORYSLAVETS Dmytro HUXFORD Rachael KRENTZEL Daniel LI Tong MARCONATO Luca MCCORMICK Matthew MOOS Franziska MROZ Filip ÖZDEMIR Bugra PAVIE Benjamin PERLMAN Eric SCHULZ Maximilian SCHWARZ Leonardo SPITZ Hannes STANSBY David STEFFEN Fabio STOMA Szymon STURZENEGGER Flurin VIERDAG Wouter-Michiel WINDHAGER Jonas YAMAUCHI Kevin ZUBAREV Igor MOORE Josh RZEPKA Norman TISCHER Christian ULMAN Vladimír UHLMANN Virginie

  Výzkumná zpráva, souhrnná výzkumná zpráva

  Rok: 2025, DOI

• DeepFuse: A multi-rater fusion and refinement network for computing silver-standard annotations

  AKBAS Cem Emre ULMAN Vladimír MAŠKA Martin KOZUBEK Michal

  Recenzovaný odborný článek

  Computers in Biology and Medicine, rok: 2025, ročník: 192, vydání: Part A, DOI

• CHOTA: A Higher Order Accuracy Metric for Cell Tracking

  KAISER Timo ULMAN Vladimír ROSENHAHN Bodo

  Stať ve sborníku

  COMPUTER VISION-ECCV 2024 WORKSHOPS, PT XVI, rok: 2025, DOI

• MIFA: Metadata, Incentives, Formats and Accessibility guidelines to improve the reuse of AI datasets for bioimage analysis

  ZULUETA-COARASA Teresa JUG Florian MATHUR Aastha MOORE Josh MUNOZ-BARRUTIA Arrate ANITA Liviu BABALOLA Kolawole BANKHEAD Peter GILLOTEAUX Perrine GOGOBERIDZE Nodar JONES Martin L. KLEYWEGT Gerard J. KORIR Paul KRESHUK Anna AYBUKE Kupcu Yoldas MARCONATO Luca NARAYAN Kedar NORLIN Nils OEZDEMIR Bugra RIESTERER Jessica L. RUSSELL Craig RZEPKA Norman SARKANS Ugis SERRANO-SOLANO Beatriz TISCHER Christian UHLMANN Virginie ULMAN Vladimír HARTLEY Matthew

  Recenzovaný odborný článek

  Nature Methods, rok: 2025, ročník: 22, vydání: 11, DOI

2024

• Image processing and analysis of light sheet microscopy data

  JAIN Akanksha ULMAN Vladimír KRUMNIKL Michal PIETZSCH Tobias PREIBISCH Stephan TOMANČÁK Pavel

  Kapitola v odborné knize

  Light Sheet Fluorescence Microscopy, rok: 2024, DOI

• ImgLib2 and BigDataViewer Hackathon Prague

  EŠNER Milan ULMAN Vladimír NORLIN Nils SEKANINOVÁ Ivana JANÍČKOVÁ Eliška

  Popularizační texty

  Rok: 2024, druh: Popularizační texty

2023

• ImgLib2 and BigDataViewer Hackathon Brno

  EŠNER Milan ULMAN Vladimír NORLIN Nils SEKANINOVÁ Ivana JANÍČKOVÁ Eliška

  Popularizační texty

  Rok: 2023, druh: Popularizační texty

• The Cell Tracking Challenge: 10 years of objective benchmarking

  MAŠKA Martin ULMAN Vladimír DELGADO-RODRIGUEZ Pablo GÓMEZ-DE-MARISCAL Estibaliz NEČASOVÁ Tereza PENA Fidel A Guerrero REN Tsang Ing MEYEROWITZ Elliot M SCHERR Tim LÖFFLER Katharina MIKUT Ralf GUO Tianqi WANG Yin ALLEBACH Jan P BAO Rina AL-SHAKARJI Noor M RAHMON Gani TOUBAL Imad Eddine PALANIAPPAN Kannappan LUX Filip MATULA Petr SUGAWARA Ko MAGNUSSON Klas E G AHO Layton COHEN Andrew R ARBELLE Assaf BEN-HAIM Tal RAVIV Tammy Riklin ISENSEE Fabian JÄGER Paul F MAIER-HEIN Klaus H ZHU Yanming EDERRA Cristina URBIOLA Ainhoa MEIJERING Erik CUNHA Alexandre MUNOZ-BARRUTIA Arrate KOZUBEK Michal ORTIZ-DE-SOLÓRZANO Carlos

  Recenzovaný odborný článek

  Nature Methods, rok: 2023, ročník: 20, vydání: 7, DOI

2022

• Review of cell image synthesis for image processing

  ULMAN Vladimír WIESNER David

  Kapitola v odborné knize

  Biomedical Image Synthesis and Simulation - Methods and Applications, vydání: Vyd. 1st ed., rok: 2022, počet stran: 43 s., DOI