Informace o publikaci

Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains

Autoři

BARTAS Martin GOSWAMI Pratik LEXA Matej ČERVEŇ Jiří VOLNÁ Adriana FOJTA Miroslav BRAZDA Vaclav PEČINKA Petr

Rok publikování 2021
Druh Článek v odborném periodiku
Časopis / Zdroj Briefings in Bioinformatics
Fakulta / Pracoviště MU

Přírodovědecká fakulta

Citace
www https://doi.org/10.1093/bib/bbab129
Doi http://dx.doi.org/10.1093/bib/bbab129
Klíčová slova SARS-CoV-2; mutations; inverted repeats
Popis In a recently published paper, we have found that SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly associated with inverted repeat loci and CG dinucleotides (Goswami, Bartas et al., 2020). However, fast-spreading strains with new mutations (so-called mink farm mutations, England mutations, and Japan mutations) have been recently described. We used the new datasets to check the positioning of mutation sites in genomes of the new SARS-CoV-2 strains. Using an open-access Palindrome analyzer tool we found mutations in these new strains to be significantly enriched in inverted repeat loci.

Používáte starou verzi internetového prohlížeče. Doporučujeme aktualizovat Váš prohlížeč na nejnovější verzi.

Další info