Informace o publikaci
Biomarkers of lymph node metastasis in low-grade breast cancer: An integrated, proteomics-based approach
| Název česky | Vyhledávání biomarkerů metastazování u low-grade karcinomů prsu: Integrovaný přístup na bázi proteomiky |
|---|---|
| Autoři | |
| Rok publikování | 2010 |
| Druh | Vyžádané přednášky |
| Fakulta / Pracoviště MU | |
| Citace | |
| Popis | Naše práce je zaměřena na vyhledávání biomarkerů metastazování v souboru 96 primárních nádorů prsu rozdělených podle grade a přítomnosti uzlinových metastáz. K tomuto účelu byly použity následující proteomické přístupy: (i) SELDI-TOF MS nám umožnilo kvantifikovat 130 píků intaktních proteinů, přičemž byl detegován a identifikován jeden pík korelující se stavem uzlinových metastáz. (ii) Vybarný soubor primárních nádorů byl analyzován pomocí metodiky iTRAQ-2DLC-MS/MS. Tento přístup umožňuje současnou identifikaci a vantifikaci více než 600 proteinů. Diferenciálně experimované proteiny náleží do několika funkčních skupin, které byly podrobně popsány v prezentaci. (iii) Vybraný soubor nádrových lyzátů byl analyzován také pomocí 2-D PAGE. Navíc, expresní profily 26 genových produktů byly evaluovány pomocí qRT-PCR. V souhrnu naše výsledky naznačují rozdílnou expresi cytoskeletálních proteinů, proteinů rodiny anterior-gradient a proteinů zapojených do biosystézy hemu. |
| Související projekty: |