doc. Ing. Matej Lexa, Ph.D.

2026

• Climate-driven in-situ trait variation in an annual ruderal grass across Europe

  VILLHAUER Helene HELLWIG Timo LABAROSA Sandy Jan METZGER Sabine MOORE Jonathan WYSOCKI Adrian STRAUBE Henryk BLUME Denise V M STRAUBE Jannis DURKA Walter BRANKOV Milan KONOWALIK Kamil LEXA Matej BUCHAROVA Anna

  Recenzovaný odborný článek

  ANNALS OF BOTANY, rok: 2026, DOI

• Creatine kinase B, a downstream effector of c-Myb, controls migration of osteosarcoma cells via regulation of N-cadherin

  POKLUDOVÁ Jana LAPČÍK Petr STANICZKOVÁ ZAMBO Iva KOHOUTEK Jiří ZAPLETALOVÁ Danica MÚDRY Peter ADÁMKOVÁ Dagmar ČERVINKA Jakub LOJA Tomáš LEXA Matej VERNER Jan ŠMARDA Jan BOUCHAL Pavel KNOPFOVÁ Lucia BENEŠ Petr

  Recenzovaný odborný článek

  Cancer Cell International, rok: 2026, ročník: 26, vydání: 1, DOI

• Metabolic disease variants rewire gene regulation through disruption of DNA G-quadruplex structures

  LAHNSTEINER Angelika ELLMER Victoria SCHONAUER Esther HUBER Julia LEXA Matej WIEDERSTEIN Markus RISCH Angela

  Recenzovaný odborný článek

  GENOME BIOLOGY, rok: 2026, DOI

2025

• bafiq: BAM Flag Index Tool for Faster Repeated Queries of Mapped Reads

  KOTRS Jan LEXA Matej

  Stať ve sborníku

  Workshop on Bioinformatics and Computational Biology (WCBC 2025), rok: 2025

• Developing molecular surveillance of SARS-CoV-2 in the Czech Republic (2021–2022)

  ŠÚRI Timotej PFEIFEROVÁ Lucie BEZDÍČEK Matěj SVATOŇ Jan HAMPL Vladimír BERKA Karel JIŘINCOVÁ Helena LENGEROVÁ Martina KOLÍSKO Martin NAGY Alexander TACHEZY Ruth ZMUDA Martin ZAJÍC Tomáš YUSHKEVICH Artsemi WISNIEWSKA Monika VRBSKÝ Jan VOSTŘÁK David VEČEŘOVÁ Jaromíra TREITLI Sebastian Cristian TRACHTOVÁ Karolína TOMKOVÁ Markéta TICHÝ Boris TICE Alexander STRÁNECKÝ Viktor ŠTILLEROVÁ Kateřina SOBOTÍKOVÁ Klára SLAVKOVSKÝ Rastislav ŠIŠKA Branislav ŠÍMA Radek SILBERMAN Jeffrey SALOMAKI Eric ŠÁCHOVÁ Jana RUDA Miroslav POSPÍŠEK Martin POLÁKOVÁ Ingrid PASZEKOVÁ Helena PASULKA Josef ORLÍKOVÁ Hana OBR Adam NUNVÁŘ Jaroslav NOVOTNÝ Marian NIKLOVA Eva NENAROKOV Serafim MRÁZEK Jakub MORAVČÍK Ondřej MEDOVÁ Hana MATYSKA Luděk MATĚJOVÁ Kateřina MALÝ Marek MACKOVÁ Barbora MACHÁŇ Jan LIPTÁKOVÁ Monika LEXA Matej KYNČL Jan KUČEROVÁ Jana Fialová KUBOVČIAK Jan KRACÍK Martin KOZÁKOVÁ Jana KOCOURKOVÁ Šárka KLIMEŠ Daniel JEŽO Eduard JAROMĚŘSKÁ Michaela JANČÁŘOVÁ Magdalena HRDÁ Štěpánka HRADILOVÁ Miluše HORNA Patrik HOLUB Petr HEJRET Václav HAMPLOVÁ Blanka HAJDÚCH Marián GONZÁLEZ Alejandro Jiménez GANČARČÍKOVÁ Markéta FÜSSY Zoltán FURMAN Viktor FRANKO Filip FIALOVÁ Alena EHLER Edvard DŘEVÍNEK Pavel DOLINOVÁ Iva CHUDĚJOVÁ Kateřina ČERNÝ Jiří ČECHOVÁ Monika ČECH Martin BYSTRÝ Vojtěch BROŽ Petr BARTOŠ Jan KOLÁŘ Michal PAČES Jan

  Recenzovaný odborný článek

  Scientific Reports, rok: 2025, ročník: 15, vydání: 1, DOI

• Factors determining chromosomal localization of transposable elements in plants

  KEJNOVSKÝ Eduard JEDLIČKA Pavel LEXA Matej KUBÁT Zdeněk

  Recenzovaný odborný článek

  PLANT BIOLOGY, rok: 2025, ročník: 27, vydání: 6, DOI

2024

• A perspective on genetic and polygenic risk scores - advances and limitations and overview of associated tools

  SCHWARZEROVÁ Jana HURTA Martin BARTOŇ Vojtěch LEXA Matej WALTHER Dirk PROVAZNÍK Valentine WECKWERTH Wolfram

  Recenzovaný odborný článek

  Briefings in Bioinformatics, rok: 2024, ročník: 25, vydání: 3, DOI

• Detection and classification of long terminal repeat sequences in plant LTR-retrotransposons and their analysis using explainable machine learning

  HORVÁTH Jakub JEDLIČKA Pavel KRÁTKÁ Marie KUBÁT Zdeněk KEJNOVSKÝ Eduard LEXA Matej

  Recenzovaný odborný článek

  BIODATA MINING, rok: 2024, ročník: 17, vydání: 1, DOI

• High-throughput spike detection in greenhouse cultivated grain crops with attention mechanisms based deep learning models

  ULLAH Sajid PANZAROVÁ Klára TRTÍLEK Martin LEXA Matej MÁČALA Vojtěch ALTMANN Thomas NEUMANN Kerstin HEJÁTKO Jan PERNISOVÁ Markéta GLADILIN Evgeny

  Recenzovaný odborný článek

  Plant Phenomics, rok: 2024, ročník: 6, vydání: March, DOI

2023

• Alternatives to classical HiC data analysis

  LEXA Matej HEGYI Hedvig

  Stať ve sborníku

  Workshop on Bioinformatics and Computational Biology (WBCB 2023), rok: 2023