Mgr. Karel Škubník, Ph.D.

2025

• Mechanism of RNA polymerase II elongation complex condensation

  ŠEBESTA Marek ŠKUBNÍK Karel MORTON William Shakespeare LINHARTOVÁ Kateřina KLÁPŠŤOVÁ Veronika NOVÁČEK Jiří KUBÍČEK Karel VÁCHA Robert ŠTEFL Richard

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2025, druh: Konferenční abstrakty

• TarMi (Target and Mill)

  NOVÁČEK Jiří KŘEPELKA Pavel MAKOVSKÝ David ŠKUBNÍK Karel

  Software

  Rok: 2025

2024

• Endosome rupture enables enteroviruses from the family Picornaviridae to infect cells

  ISHEMGULOVA Aygul MUKHAMEDOVA Liya TREBICHALSKÁ Zuzana ŠEMBEROVÁ RÁJECKÁ Veronika PAYNE Pavel ŠMERDOVÁ Lenka MORAVCOVÁ Jana HREBÍK Dominik BUCHTA David ŠKUBNÍK Karel FÜZIK Tibor VAŇÁČOVÁ Štěpánka NOVÁČEK Jiří PLEVKA Pavel

  Článek v odborném periodiku

  Communications Biology, rok: 2024, ročník: 7, vydání: 1, DOI

• Mechanisms of transcription attenuation and condensation of RNA polymerase II by RECQ5 helicase

  ŠEBESTA Marek ŠKUBNÍK Karel MORTON William Shakespeare KRAVEC Marek LINHARTOVÁ Kateřina KLÁPŠŤOVÁ Veronika NOVÁČEK Jiří KUBÍČEK Karel BRYJA Vítězslav VÁCHA Robert ŠTEFL Richard

  Další prezentace na konferencích

  Rok: 2024, druh: Další prezentace na konferencích

• Structural characterization of two prototypical repressors of SorC family reveals tetrameric assemblies on DNA and mechanism of function

  SOLTYSOVA Marketa SKERLOVA Jana PACHL Petr ŠKUBNÍK Karel FABRY Milan SIEGLOVA Irena FAROLFI Martina GRISHKOVSKAYA Irina BABIAK Michal NOVÁČEK Jiří KRASNY Libor REZACOVA Pavlina

  Článek v odborném periodiku

  Nucleic acids research, rok: 2024, ročník: 52, vydání: 12, DOI

• The interplay of δ-subunit and RNA polymerase in the pre-initiation state

  ČERNÝ Martin KOZÁKOVÁ Anna MIKESKOVÁ Klára ŠANDEROVÁ Hana ŠKUBNÍK Karel KRÁSNÝ Libor ŽÍDEK Lukáš

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2024, druh: Konferenční abstrakty

2023

• Conformational changes in baseplate required for genome delivery of S. aureus phage phi812

  BÍŇOVSKÝ Ján ŠIBOROVÁ Marta NOVÁČEK Jiří ŠKUBNÍK Karel BOTKA Tibor BENEŠÍK Martin PANTŮČEK Roman VAN RAAIJ MARK PLEVKA Pavel

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

• Elucidating the Mechanisms of Genome Release in Picornaviruses using Cryo-EM and Coarse-Grained Simulations

  SUKENÍK Lukáš MUKHAMEDOVA Liya PROCHÁZKOVÁ Michaela ŠKUBNÍK Karel PLEVKA Pavel VÁCHA Robert

  Konferenční abstrakty

  Rok: 2023, druh: Konferenční abstrakty

2022

• Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions

  SIMONOVA Anna ROMANSKA Veronika BENONI Barbora ŠKUBNÍK Karel ŠMERDOVÁ Lenka PROCHÁZKOVÁ Michaela SPUSTOVA Kristina MORAVCIK Ondrej GAHUROVA Lenka PACES Jan PLEVKA Pavel CAHOVA Hana

  Článek v odborném periodiku

  Chembiochem, rok: 2022, ročník: 23, vydání: 17, DOI

• Human myelin proteolipid protein structure and lipid bilayer stacking

  RUSKAMO Salla RAASAKKA Arne PEDERSEN Jan Skov MARTEL Anne ŠKUBNÍK Karel DARWISH Tamim PORCAR Lionel KURSULA Petri

  Článek v odborném periodiku

  Cellular and molecular life sciences, rok: 2022, ročník: 79, vydání: 8, DOI