RNDr. Vladimír Ulman, Ph.D.

2018

• FiloGen: A Model-Based Generator of Synthetic 3-D Time-Lapse Sequences of Single Motile Cells with Growing and Branching Filopodia

  SOROKIN Dmitry PETERLÍK Igor ULMAN Vladimír SVOBODA David NEČASOVÁ Tereza MORGAENKO Katsiarina EISELLEOVÁ Lívia TESAŘOVÁ Lenka MAŠKA Martin

  Článek v odborném periodiku

  IEEE Transactions on Medical Imaging, rok: 2018, ročník: 37, vydání: 12, DOI

• Model-Based Generation of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Multiple Mutually Interacting Motile Cells with Filopodia

  PETERLÍK Igor SVOBODA David ULMAN Vladimír SOROKIN Dmitry MAŠKA Martin

  Článek ve sborníku

  Simulation and Synthesis in Medical Imaging, rok: 2018

2017

• An objective comparison of cell-tracking algorithms

  ULMAN Vladimír MAŠKA Martin MAGNUSSON Klas E G RONNEBERGER Olaf HAUBOLD Carsten HARDER Nathalie MATULA Pavel MATULA Petr SVOBODA David RADOJEVIC Miroslav SMAL Ihor ROHR Karl JALDÉN Joakim BLAU Helen M DZYUBACHYK Oleh LELIEVELDT Boudewijn XIAO Pengdong LI Yuexiang CHO Siu-Yeung DUFOUR Alexandre C OLIVO-MARIN Jean-Christophe REYES-ALDASORO Constantino C SOLIS-LEMUS Jose A BENSCH Robert BROX Thomas STEGMAIER Johannes MIKUT Ralf WOLF Steffen HAMPRECHT Fred A ESTEVES Tiago QUELHAS Pedro DEMIREL Ömer MALMSTRÖM Lars JUG Florian TOMANCAK Pavel MEIJERING Erik MUNOZ-BARRUTIA Arrate KOZUBEK Michal ORTIZ-DE-SOLORZANO Carlos

  Článek v odborném periodiku

  Nature Methods, rok: 2017, ročník: 14, vydání: 12, DOI

• MitoGen: A Framework for Generating 3D Synthetic Time-Lapse Sequences of Cell Populations in Fluorescence Microscopy

  SVOBODA David ULMAN Vladimír

  Článek v odborném periodiku

  IEEE Transactions on Medical Imaging, rok: 2017, ročník: 36, vydání: 1, DOI

• Model-Based Generation of Synthetic 3D Time-Lapse Sequences of Motile Cells with Growing Filopodia

  SOROKIN Dmitry PETERLÍK Igor ULMAN Vladimír SVOBODA David MAŠKA Martin

  Článek ve sborníku

  14th IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, rok: 2017

2016

• Vascular Network Formation in Silico Using the Extended Cellular Potts Model

  SVOBODA David ULMAN Vladimír KOVÁČ Peter ŠALINGOVÁ Barbara TESAŘOVÁ Lenka KRONTORÁD KOUTNÁ Irena MATULA Petr

  Článek ve sborníku

  2016 IEEE International Conference on Image Processing, rok: 2016

• Virtual cell imaging: A review on simulation methods employed in image cytometry

  ULMAN Vladimír SVOBODA David NYKTER Matti KOZUBEK Michal RUUSUVUORI Pekka

  Článek v odborném periodiku

  Cytometry Part A, rok: 2016, ročník: 89A, vydání: 12, DOI

2015

• On Proper Simulation of Chromatin Structure in Static Images As Well As in Time-Lapse Sequences in Fluorescence Microscopy

  SVOBODA David ULMAN Vladimír PETERLÍK Igor

  Článek ve sborníku

  Proceedings of 2015 IEEE International Symposium on Biomedical Imaging, rok: 2015

• TRAgen: A Tool for Generation of Synthetic Time-Lapse Image Sequences of Living Cells

  ULMAN Vladimír ORÉMUŠ Zoltán SVOBODA David

  Článek ve sborníku

  Proceedings of 18th International Conference on Image Analysis and Processing, rok: 2015

2014

• A Benchmark for Comparison of Cell Tracking Algorithms

  MAŠKA Martin ULMAN Vladimír SVOBODA David MATULA Pavel MATULA Petr EDERRA Cristina URBIOLA Ainhoa ESPANA Tomás VENKATESAN Subramanian BALAK Deepak M W KARAS Pavel BOLCKOVÁ Tereza ŠTREITOVÁ Markéta CARTHEL Craig CORALUPPI Stefano HARDER Nathalie ROHR Karl MAGNUSSON Klas E G JALDÉN Joakim BLAU Helen M DZYUBACHYK Oleh KŘÍŽEK Pavel HAGEN Guy M PASTOR-ESCUREDO David JIMENEZ-CARRETERO Daniel LEDESMA-CARBAYO Maria J MUNOZ-BARRUTIA Arrate MEIJERING Erik KOZUBEK Michal ORTIZ-DE-SOLORZANO Carlos

  Článek v odborném periodiku

  Bioinformatics, rok: 2014, ročník: 30, vydání: 11, DOI